Alzheimerova choroba je s věkem spojené neurodegenerativní onemocnění, které zapříčiňuje vznik demence, ztrátu paměti a další kognitivní změny. Její incidence neustále roste a je potřeba pochopit mechanismy a vlivy, které se podílejí na rozvoji této doposud neléčitelné choroby. Tato diplomová práce se zabývá cílenou lipidomickou analýzou mozkových homogenátů k popisu změn v lipidomickém profilu myších modelů Alzheimerovy choroby oproti kontrolním modelům. Teoretická část se zabývá Alzheimerovou chorobou a dysregulací lipidového metabolismu. Dále je zde pojednáváno o ABC transportérech, myších modelech, lipidomice a analytických metodách. V experimentální části byly analyzovány vzorky homogenátů myších mozků metodou kapalinové chromatografie s hmotnostní spektrometrií a následně byla provedena statistická analýza dat. U modelu APP/PS1 bylo oproti kontrolnímu modelu pozorováno signifikantní zvýšení koncentrace mastných kyselin, ceramidů, lysofosfatidylcholinů a lysofosfatidylethanolaminů, snížení koncentrací pak bylo pozorováno u fosfatidylcholinů, diacylglycerolů, sfingomyelinů a fosfatidylethanolaminů. Bioinformatickou analýzou dat byly predikovány geny a enzymy, které mohou mít spojitost se změnami v hladinách lipidů. Tato práce komplexně popisuje změny v lipidovém metabolismu v mozku vlivem Alzheimerovy choroby a identifikuje klíčové lipidy, enzymy a geny, které mohou být zapojeny do její patobiochemie.Alzheimer's disease is an age-related neurodegenerative disease that causes dementia, memory loss and other cognitive changes. Its incidence is steadily increasing and there is a need to understand the mechanisms and influences involved in development of this so far incurable disease. This master's thesis focuses on targeted lipidomic analysis of brain homogenates to describe changes in the lipidomic profile of mouse models of Alzheimer's disease compared to control models. The theoretical part deals with Alzheimer's disease and dysregulation of lipid metabolism. It also discusses ABC transporters, mouse models, lipidomics and analytical tools. In the experimental part, samples of mouse brain homogenates were analyzed by liquid chromatography-mass spectrometry followed by statistical analysis of the data. In model APP/PS1 was observed significant increase in the concentration of fatty acids, ceramids, lysophosphatidylcholines and lysophosphatidylethanolamines, decline in concentrations was observed for phosphatidylcholines, diacylglycerols, sphingomyelins and phosphatidylethanolamines Bioinformatic data analysis was used to predict genes and enzymes that may be associated with the changes in lipid levels. This work comprehensively describes changes in lipid metabolism in the brain due to Alzheimer's disease and identifies key lipids, enzymes and genes that may be involved in its patobiochemistry.