Number of the records: 1
Identification and expression analysis of species-specific genes in plant hybrids
Údaje o názvu Identification and expression analysis of species-specific genes in plant hybrids [rukopis] / Marie Chudecká Další variantní názvy Identifikace a analýza exprese druhově specifických genů v rostlinných křížencích Osobní jméno Chudecká, Marie, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Identification and expression analysis of species-specific genes in plant hybrid Vyd.údaje 2023 Fyz.popis 52 : il., tab. Poznámka Ved. práce David Kopecký Oponent Petr Dvořák Dal.odpovědnost Kopecký, David, 1978- (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dvořák, Petr (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Druhově specifické geny * mezidruhová hybridizace * genová exprese * genová ontologie * Lineage-specific genes * orphan genes * interspecific hybridisation * gene expression * gene ontology Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. angličtina Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biochemie Studijní obor Bioinformatika book
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00282690-379255099.pdf 8 1.2 MB 15.05.2023 Posudek Typ posudku 00282690-ved-700058526.pdf Posudek vedoucího 00282690-opon-449739847.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00282690-prubeh-361295465.pdf 21.02.2022 15.05.2023 14.06.2023 A Hodnocení známkou Ostatní přílohy Velikost Popis 00282690-other-615934783.zip 10.5 KB 00282690-other-554765478.zip 45.3 MB
Druhově specifické geny jsou přítomné v genomech drtivé většiny organism, včetně rostlinných a živočišných druhů. Alespoň část z nich má pro své nositele zřejmě význam v adaptaci na okolní prostředí. Regulace jejich exprese je mnohoúrovňový mechanismus, který je značně modifikován po mezidruhové hybridizaci, tj. sloučení genomů dvou různých druhů. Tato práce zabývá se dosud nezkoumaným osudem druhově specifických genů v mezidruhových křížencích. S využitím dostupných sekvenčních dat a de novo sestavených transkriptomů byly identifikovány druhově specifické geny pro dva druhy trav, Festuca pratensis a Lolium multiflorum a studována jejich exprese jak v obou rodičovských druzích, tak v jejich křížencích (Festulolium). Byla rovněž provedená jednoduchá funkční anotace s důrazem na genovou ontologii.Lineage-specific genes are present in genomes across all kingdoms of life tree and are recognised for their adaptive potential. However, regulation of their expression is a multi-layered mechanism, which undergoes significant changes in a hybrid genome. This thesis examines the previously unexplored interplay of the functionality of these genes with interspecific hybridisation by studying their presence, characteristics and expression patterns in two grass species, Festuca pratensis and Lolium multiflorum, and their hybrids called Festulolium. Species-specific genes are identified for both species using available sequence data and de novo transcriptome assembly. Functional annotation, with emphasis on gene ontology, is performed. Finally, existing transcription data are employed in expression analysis.
Number of the records: 1