Number of the records: 1
Analýza transkriptomu v průběhu vývoje embrya Sorghum purpureosericeum
Title statement Analýza transkriptomu v průběhu vývoje embrya Sorghum purpureosericeum [rukopis] / Tereza Bojdová Additional Variant Titles Analýza transkriptomu v průběhu vývoje embrya Sorghum purpureosericeum Personal name Bojdová, Tereza, (dissertant) Translated title Transcriptome analysis of developing embryo of Sorghum purpureosericeum Issue data 2023 Phys.des. 75 : tab. Note Ved. práce Jan Bartoš Oponent Radim Čegan Another responsib. Bartoš, Jan (thesis advisor) Čegan, Radim, (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého v Olomouci. Přírodovědecká fakulta. Katedra biotechnologií (degree grantor) Keywords Sorghum purpureosericeum * B chromozómy * eliminace B chromozómů * transkriptomika * Sorghum purpureosericeum * B chromosomes * B chromosome elimination * transkriptomics Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biotechnologie a genové inženýrství Degreee discipline Biotechnologie a genové inženýrství book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00282681-233993996.pdf 0 2.2 MB 02.05.2023 Posudek Typ posudku 00282681-ved-139691556.pdf Posudek vedoucího 00282681-opon-767984204.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00282681-prubeh-970905798.pdf 30.09.2021 02.05.2023 30.05.2023 A Hodnocení známkou
Divoký druh čiroku Sorghum purpureosericeum může nad rámec své chromozomální sady obsahovat také nadbytečné B chromozómy, což jsou postradatelné elementy, které svým hostitelským organismům zpravidla neposkytují žádnou výhodu. B chromozómy S. purpureosericeum nejsou stabilní ve všech pletivech a během brzkého embryonálního vývoje dochází k jejich eliminaci ze všech pletiv kromě nediferenciovaných meristémů nadzemních orgánů. Cílem této práce bylo vytvoření referenční genomové sekvence S. purpureosericeum a transkriptomická analýza RNA-Seq dat embryí v různém stádiu vývoje za účelem selekce kandidátních genů, které jsou odlišně exprimovány a mohly by být zodpovědné za eliminaci B chromozómů.The wild species Sorghum purpureosericeum can contain supernumerary B chromosomes in addition to its normal chromosomal set. B chromosomes are dispensable elements that typically provide no advantage to their host organisms. B chromosomes of S. purpureosericeum are not stable and are eliminated from all tissues except apical meristem during early embryonic development. The aim of this study was to create a reference genome sequence of S. purpureosericeum and perform transcriptomic analysis of RNA-Seq data from embryos at different stages of development in order to identify candidate genes that are differentially expressed and could be responsible for B chromosome elimination.
Number of the records: 1