Number of the records: 1  

Identifikácia chromozomálnych prestavieb v rodu Musa spp. s využitím Oxford Nanopore sekvencií

  1. Title statementIdentifikácia chromozomálnych prestavieb v rodu Musa spp. s využitím Oxford Nanopore sekvencií [rukopis] / Simona Martikánová
    Additional Variant TitlesIdentifikace chromozomálních přestaveb v rodu Musa spp. s využitím Oxford Nanopore sekvencí
    Personal name Martikánová, Simona, (dissertant)
    Translated titleIdentification of chromosomal rearrangements in Musa spp. using Oxford Nanopore sequencing
    Issue data2023
    Phys.des.71 : tab.
    NoteVed. práce Eva Hřibová
    Oponent Zuzana Tulpová
    Another responsib. Hřibová, Eva (thesis advisor)
    Tulpová, Zuzana (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords Banánovník * translokácia * Oxford Nanopore sekvenovanie * chromozómy * genóm * Banana tree * translocation * Oxford Nanopore sequencing * chromosomes * genome
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languageslovenština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBioinformatika
    Degreee disciplineBioinformatika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00279171-595535670.pdf276.8 MB16.05.2023
    PosudekTyp posudku
    00279171-ved-209474400.pdfPosudek vedoucího
    00279171-opon-199908737.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00279171-prubeh-370403806.pdf14.10.202116.05.202314.06.2023BHodnocení známkou
    Ostatní přílohySizePopis
    00279171-other-367912935.zip1.3 MB

    Banánovník (Musa spp.) je rod bylín z čeľade Musaceae. Najdôležitejšie typy jedlých banánov pochádzajú z hybridizácie dvoch druhov: Musa acuminata a Musa balbisiana. Pozorovanie nepravidelností párovania chromozómov v meióze hybridov medzi týmito poddruhmi naznačovalo prítomnosť veľkých chromozomálnych štrukturálnych prestavieb, hlavne translokácií. Nanopórové sekvenovanie je prístup tretej generácie, ktorý umožňuje získanie DNA alebo RNA sekvencií. V tejto práci sme sa zamerali na použitie čítaní získaných s metódou Oxford Nanopore pre genóm banánovníka pre identifikáciu veľkých chromozomálnych translokácií a ich vizualizáciu.Banana (Musa spp.) is a genus of herbs from the Musaceae family. The most important types of edible bananas come from the hybridization of two species: Musa acuminata and Musa balbisiana. Observation of chromosome pairing irregularities in meiosis of hybrids between these subspecies indicated the presence of large chromosomal structural rearrangements, mainly translocations. Nanopore sequencing is a third-generation approach that allows obtaining DNA or RNA sequences. In this work, we focused on using the Oxford Nanopore reads for the banana genome for a large number of chromosomal translocations and their visualization.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.