Cílem práce bylo zmapovat stabilitu polárních interakcí u protein-DNA komplexů v molekulově dynamických simulacích. Celkem jsem studoval tři protein-DNA komplexy, u kterých jsem se zaměřil převážně na interakce, které se nazývají solné můstky, jež jsou zde formovány kladně nabitými aminokyselinami lysinem a argininem a záporně nabitými páteřními fosfáty v DNA. Simulace jsem realizoval v silovém poli OL15. Získané výsledky mohou v budoucnu pomoci při zpřesňování silových polí.The aim of this work was to map the stability of polar interactions in protein-DNA complexes in molecular dynamics simulations. In total, I studied three protein-DNA complexes, where I focused mainly on interactions called salt bridges, which are formed by the positively charged amino acids lysine and arginine and negatively charged backbone phosphates in DNA. The simulations were carried out in the OL15 force field. The results obtained may help to refine the force fields in the future.