Number of the records: 1  

Identifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis

  1. Title statementIdentifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis [rukopis] / Adéla Nedavašková
    Additional Variant TitlesIdentifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis
    Personal name Nedavašková, Adéla, (dissertant)
    Translated titleIdentification of new genes involved in DNA-protein crosslink repair in Arabidopsis
    Issue data2022
    Phys.des.41 s. : il., grafy, tab.
    NoteVed. práce Eva Tomaštíková
    Oponent Jitka Jemelková
    Another responsib. Tomaštíková, Eva (thesis advisor)
    Jemelková, Jitka, (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords Arabidopsis thaliana * DNA-proteinové crosslinky * zebularin * Arabidopsis thaliana * DNA-protein crosslinks * zebularine
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00275263-412791520.pdf172.2 MB06.05.2022
    PosudekTyp posudku
    00275263-ved-149561042.pdfPosudek vedoucího
    00275263-opon-917851128.pdfPosudek oponenta

    DNA-proteinové crosslinky představují pro buňky vysoce toxické poškození v podobě kovalentního spojení proteinů s řetězcem DNA. Pokud nejsou včas opraveny, může docházet k mutacím a buněčné smrti. Naštěstí si buňky vytvořily efektivní cesty, kterými dokážou obnovit původní strukturu genetického materiálu a zachovat tak integritu genomu. Pro identifikaci genů, které hrají roli v opravách DNA-proteinových crosslinků, byl ve vědecké skupině doc. Aleše Pečinky navržen dopředný genetický screen, který využívá EMS-mutagenizované populace rostlin huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana). K indukci DNA-proteinových crosslinků sloužil zebularin - cytidinový analog, jehož schopností je zachytávat enzym METYLTRANSFERÁZU 1 na DNA a vytvářet tak sterické zábrany pro jiné enzymy spjaté s DNA. Rostliny, ve kterých vlivem mutace došlo k inaktivaci kauzálního genu, vykazovaly díky ošetření zebularinem výraznou redukci kořene. Pomocí těchto postupů byly nově objeveny kandidátní linie 21B-5 a 21B-30, k analýzám charakterizujícím efekt mutace však v rámci experimentální části bakalářské práce sloužila pouze linie 21B-5.DNA-protein crosslinks represent highly toxic damage to cells in the form of a covalent linkage of proteins with a DNA strand. If not properly repaired, DNA-protein crosslinks can lead to mutation and cell death. Fortunately, cells have evolved effective DNA repair pathways to restore the original structure of genetic material and thus maintain their genomic integrity. To identify genes that play a role in DNA-protein crosslink repair, the research group of Doc. Aleš Pečinka designed a forward-directed genetic screen that uses EMS-mutagenized populations of the thale cress (Arabidopsis thaliana). Zebularine - a cytidine analog was used to induce DNA-protein crosslinks, because of its ability to covalently trap METHYLTRANSFERASE 1 on the DNA and thus create steric hindrance to other DNA-related enzymes. Plants in which the causal gene was inactivated by the mutation showed significant root reduction after the zebularine treatment. This allowed me to find candidate lines 21B-5 and 21B-30, but only line 21B-5 was used for analysis identifying and also characterizing the causal mutation as a factor involved in DNA-protein crosslink repair.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.