Vnitrozemské sladkovodní ekosystémy, zejména pak malé tůně, jsou důležitou součástí celkového globálního cyklu uhlíku. Ale i přes jejich důležitost se jim nedostávalo tolik pozornosti a celosvětové odhady jsou značně podhodnocené. Cílem této bakalářské práce bylo zjistit jakých koncentrací a hodnot difúzních emisí dosahují CO2 a CH4 v tůních v CHKO Litovelské Pomoraví. V průběhu roku 2020 bylo měřeno celkově 24 přírodních i uměle vytvořených tůní, které byly obvykle třikrát navštíveny. Ke zjištění dat byl použit přenosný analyzátor skleníkových plynů Los Gatos Inc. Všechny sledované tůně byly primárním zdrojem oxidu uhličitého do atmosféry s průměrným celkovým denním tokem 0.11 +- 0.07 mol m-2 d-1. V případě druhého sledovaného plynu metanu byly všechny, kromě dvou tůní, zdrojem metanu s průměrnou hodnotou 0.007 +- 0.02 mol m-2 d-1. Pozitivní korelaci s celkovými denními toky CO2 měla koncentrace CO2, ale překvapivě i koncentrace CH4. Získané poznatky o emitujících plynech by mohly sloužit k lepšímu pochopení celkového cyklu uhlíku. Ale zcela určitě jsou potřeba ještě další výzkumy, a to zejména z důvodu lepšího porozumění emisního toku CO2 i CH4 v průběhu celého dne a noci.Inland freshwater ecosystems, especially small ponds, are an important part of the overall global carbon cycle. But despite their importance, they have received little attention and global estimates are significantly underestimated. The aim of this bachelor's thesis was to determine what concentrations and diffuse emission values CO2 and CH4 reach in ponds in the PLA Litovelské Pomoraví. A total of 24 natural and artificial ponds were measured during 2020, which were usually visited three times. To obtain the data, a portable greenhouse gas analyzer Los Gatos Inc was used. All monitored ponds were primary sources of carbon dioxide to the atmosphere with an average total daily flux of 0.11 +- 0.07 mol m-2 d-1. For the second monitored gas, methane, all but two ponds were sources of methane with an average of 0.007 +- 0.02 mol m-2 d-1. CO2 concentration was positively correlated with total daily fluxes, but surprisingly, so was CH4 concentration. The knowledge gained about the emitting gases could be used to better understand the overall carbon cycle. But more research is certainly needed, especially to better understand the emission flux of both CO2 and CH4 throughout the day and night.