Number of the records: 1  

Identifikace peptidů navázaných na MHC I molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie

  1. Title statementIdentifikace peptidů navázaných na MHC I molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie [rukopis] / Lubomír Machalla
    Additional Variant TitlesIdentifikace peptidů navázaných na MHCI molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie
    Personal name Machalla, Lubomír, (dissertant)
    Translated titleIdentification of MHCI bound peptides using a mass spectrometry
    Issue data2022
    Phys.des.64 : il., grafy, schémata, tab.
    NoteVed. práce Kateřina Zachová
    Oponent Ján Gurský
    Another responsib. Zachová, Kateřina, (thesis advisor)
    Gurský, Ján (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords Dendritické buňky * Spike protein * receptor vázající doména * hlavní histokompatibilní komplex * peptid * hmotnostní spektrometrie * Dendritic cells * Spike protein * receptor binding domain * major histocompatibility complex * mass spectrometry * peptide
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBiochemie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00271348-331749280.pdf422 MB26.04.2022
    PosudekTyp posudku
    00271348-ved-259316585.pdfPosudek vedoucího
    00271348-opon-588281765.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00271348-prubeh-183515587.pdf19.10.202026.04.202223.05.20221Hodnocení známkou

    Dendritické buňky jsou buňky imunitního systému, které propojují jeho vrozenou a získanou část. Patří mezi tzv. profesionální antigen prezentující buňky, které dokáží pohltit antigen pomocí fagocytózy a následně takový antigen rozložit na peptidové fragmenty. Tyto fragmenty poté dendritická buňka vystavuje na svém povrchu pomocí MHC molekul. V rámci diplomové práce byla věnována pozornost MHC I molekule a peptidům nacházejícím se na této molekule. K dendritickým buňkám byl přidán rekombinantní RBD protein pocházející z viru SARS-CoV-2. Pomocí imunoafinitní chromatografie byl komplex MHC I - peptid izolován z buněčného lyzátu. Následovalo štěpení komplexu MHC I - peptid trypsinem a kapalinová chromatografie, kde byly odseparovány jednotlivé peptidy. Identifikace peptidů byla provedena pomocí hmotnostní spektrometrie. Celkově analýza byla provedena 3x z důvodu optimalizace metody. Získané aminokyselinové sekvence peptidů byly následně porovnány pomocí databáze UniProt.Dendritic cells are cells of the immune system that connect its innate and adaptive parts. Dendritic cells belong to the group called professional antigen-presenting cells, which can absorb the antigen by phagocytosis and subsequently break down the antigen into peptide fragments. These fragments are then displayed on the cell surface using MHC molecules. Within the diploma thesis, attention was paid to the MHC I molecule and peptides bound on this molecule. To the dendritic cells was added recombinant RBD protein derived from SARS-CoV-2. The MHC I - peptide complex was isolated from the cell lysate by immunoaffinity chromatography. After that complex MHC I - peptide was digested by trypsin and peptides from the complex were separated by liquid chromatography. To the identification of peptides was used mass spectrometry. The analysis was performed 3 times to optimize the method. The obtained amino acid peptide sequences were compared using the UniProt database.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.