Cílem předložené diplomové práce byla identifikaci žákovských prekoncepcí a miskoncepcí o stavbě a funkci světelného mikroskopu u žáků 2. stupně základních škol. V teoretické části byla zpracována komparativní obsahová analýza problematiky práce s mikroskopem v učebnicích přírodopisu pro 2. stupeň základních škol a literární rešerše shrnující dosavadní výzkumy týkající se problematiky hodnocení žákovských mikroskopických dovedností a jejich významu při výuce biologie. V praktické části byl proveden výzkum žákovských prekoncepcí a miskoncepcí o stavbě a funkci světelného mikroskopu pomocí konceptového testu. Z výsledků vyplývá, že žáci 6. a 7. ročníku mají lepší představy o stavbě a funkci mikroskopu v porovnání s žáky 9. ročníku. Dále jen velmi málo žáků obou výzkumných skupin dokázalo správně určit hodnotu nejmenšího a největšího zvětšení mikroskopu, vlastnosti obrazu pozorovaného pod mikroskopem a vysvětlit správné zásady při mikroskopování.The aim of the submitted diploma thesis was to identify pupils preconceptions and misconceptions about the structure and function of the light microscope at lower secondary school. In the theoretical part of the thesis, a comparative content analysis focused on light microscopy in biology textbooks for lower secondary schools was prepared, as well as literature review summarizing selected results of research highlighting evaluation of pupils microscopy skills. In the practical part of the thesis, a research of pupils preconceptions and misconceptions about the structure and function of the light microscope using a conceptual test was performed. The results show that pupils in grade 6 and grade 7 have slightly more developed scientific preconceptions about the structure and function of the compound light microscope compared to pupils in grade 9. Furthermore, only few pupils in both research groups were able to correctly determine the value of the smallest and largest magnification of the light microscope, describe the properties of the image observed under the microscope and explain specific steps how to focus a specimen when using a microscope.