Number of the records: 1  

Analýza repetitivních sekvencí B chromozomu u druhu Sorghum purpureosericeum

  1. Title statementAnalýza repetitivních sekvencí B chromozomu u druhu Sorghum purpureosericeum [rukopis] / Karel Vrabka
    Additional Variant TitlesAnalýza repetitivních sekvencí B chromozomu u druhu Sorghum purpureosericeum
    Personal name Vrabka, Karel, (dissertant)
    Translated titleAnalysis of repetitive sequences of B chromosome in Sorghum purpureosericeum
    Issue data2021
    Phys.des.55 s. (86 289 znaků) : il., grafy, schémata, tab. + 1 CD ROM
    NoteVed. práce Jan Bartoš
    Oponent Karol Krak
    Another responsib. Bartoš, Jan (thesis advisor)
    Krak, Karol, (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords B chromozomy * Sorgum purpureosericeum * RepeatExplorer * repetitivní sekvence DNA * DNA * B chromosomes * Sorgum purpureosericeum * RepeatExplorer * repetitive DNA sequences * DNA
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBioinformatika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00263747-666456669.pdf232.2 MB19.05.2021
    PosudekTyp posudku
    00263747-ved-646611185.pdfPosudek vedoucího
    00263747-opon-862806959.pdfPosudek oponenta
    Ostatní přílohySizePopis
    00263747-other-310602558.zip13.4 KB
    00263747-other-690282271.zip10.7 MB

    B chromozomy jsou nadpočetnou součástí karyotypu podléhající specifickému způsobu dědičnosti, které se vyskytují v genomech rozličných druhů rostlin i zvířat. Jejich přítomnost byla odhalena rovněž u rodu Sorghum, jehož zástupci mají hospodářský význam a i proto je podstatná správná identifikace genotypů jednotlivých rostlin. V této práci byla provedena úprava sekvenačních dat z rodu Sorghum purpureosericeum, na datech byla poté provedena komparativní klastrová analýza softwarem RepeatExplorer, jež vedla k identifikaci repetitivních sekvencí v genomu. Součástí výsledků práce je rovněž vyvinutý software ke zpracování a vizualizaci výsledků komparativní analýzy.B chromosomes are supernumerary part of karyotypes characterized by specific type of chromosomes transmission rates, which are part of genomes of various plants and animals. Presence of B chromosomes was also discovered in species of Sorghum genus. Sorghum species are not only used in food industry, but also represent important source of genes, that could be used in breeding. This thesis describes a workflow for comparative analysis of repeat DNA from Sorghum purpureosericeum using RepeatExplorer cluster analyses. The software implemented for processing processing and visualization of RepatExplorer output files is a part of thesis result.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.