Number of the records: 1
Analýza repetitivních sekvencí B chromozomu u druhu Sorghum purpureosericeum
Title statement Analýza repetitivních sekvencí B chromozomu u druhu Sorghum purpureosericeum [rukopis] / Karel Vrabka Additional Variant Titles Analýza repetitivních sekvencí B chromozomu u druhu Sorghum purpureosericeum Personal name Vrabka, Karel, (dissertant) Translated title Analysis of repetitive sequences of B chromosome in Sorghum purpureosericeum Issue data 2021 Phys.des. 55 s. (86 289 znaků) : il., grafy, schémata, tab. + 1 CD ROM Note Ved. práce Jan Bartoš Oponent Karol Krak Another responsib. Bartoš, Jan (thesis advisor) Krak, Karol, (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords B chromozomy * Sorgum purpureosericeum * RepeatExplorer * repetitivní sekvence DNA * DNA * B chromosomes * Sorgum purpureosericeum * RepeatExplorer * repetitive DNA sequences * DNA Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biochemie Degreee discipline Bioinformatika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00263747-666456669.pdf 26 2.2 MB 19.05.2021 Posudek Typ posudku 00263747-ved-646611185.pdf Posudek vedoucího 00263747-opon-862806959.pdf Posudek oponenta Ostatní přílohy Size Popis 00263747-other-310602558.zip 13.4 KB 00263747-other-690282271.zip 10.7 MB
B chromozomy jsou nadpočetnou součástí karyotypu podléhající specifickému způsobu dědičnosti, které se vyskytují v genomech rozličných druhů rostlin i zvířat. Jejich přítomnost byla odhalena rovněž u rodu Sorghum, jehož zástupci mají hospodářský význam a i proto je podstatná správná identifikace genotypů jednotlivých rostlin. V této práci byla provedena úprava sekvenačních dat z rodu Sorghum purpureosericeum, na datech byla poté provedena komparativní klastrová analýza softwarem RepeatExplorer, jež vedla k identifikaci repetitivních sekvencí v genomu. Součástí výsledků práce je rovněž vyvinutý software ke zpracování a vizualizaci výsledků komparativní analýzy.B chromosomes are supernumerary part of karyotypes characterized by specific type of chromosomes transmission rates, which are part of genomes of various plants and animals. Presence of B chromosomes was also discovered in species of Sorghum genus. Sorghum species are not only used in food industry, but also represent important source of genes, that could be used in breeding. This thesis describes a workflow for comparative analysis of repeat DNA from Sorghum purpureosericeum using RepeatExplorer cluster analyses. The software implemented for processing processing and visualization of RepatExplorer output files is a part of thesis result.
Number of the records: 1