Práce se zabývá přípravou, sestavením a analýzou vakuového a optického uspořádání pro experimenty s atomárními ionty zachycenými v Pauliho pastech. Bude obsahovat přípravu a kalibraci turbomolekulární čerpací soustavy, charakterizaci optických aberací vakuových oken a sestavení samotné aparatury. Hlavním cílem je dosažení ultra-vysokého vakua v aparatuře obsahující iontovou past a podrobná charakterizace reziduálních plynů.This thesis contains the preparation, assembly and analysis of vacuum and optical arrangements for experiments with atomic ions in Pauli traps. It will include the preparation and calibration of the turbomolecular pumping system, the characterization of optical aberrations of main vacuum viewports and the assembly of the apparatus itself. The main objective is to achieve an ultra-high vacuum in the apparatus containing the ion trap and a detailed characterization of the residual gases.