Teoretická část diplomové práce se zabývá popisem kapilární elektroforézy a jejího spojení s hmotnostní spektrometrií. Zmíněny jsou také vybrané inhibitory tyrosin kinázy. Úkolem inhibitorů tyrosin kináz je blokování nekontrolovatelného růstu buněk. Cílem experimentální části bylo vyvinout metodu na separaci vybraných inhibitorů tyrosin kináz pomocí spojení CE-MS a optimalizace klíčových parametrů, jako je složení elektrolytu, podmínky separace a podmínky hmotnostní spektrometrie. Výsledkem práce je metoda pro separaci s optimálními podmínkami. Na základě porovnání mezí detekce (LOD) a mezí stanovitelnosti (LOQ) jednotlivých analytů s koncentrací těchto látek v biologickém materiálu bylo vyhodnoceno, že daná metoda je vhodná pro analýzu vybraných inhibitorů v biologických vzorcích.The theoretical part of this thesis is focused on the description of capillary electrophoresis and capillary electrophoresis-mass spectromestry. Some of the tyrosine kinase inhibitors are also mentioned. The purpose of tyrosine kinase inhibitors is to slowdown the uncontrollable growth of cells. The aim of experimental part of this thesis is to develop a method for separation of selected tyrosine kinase inhibitors by CE-MS including optimization of key parameters like the composition of background electrolyte, and conditions of separation and mass spectrometry. The work resulted in a method for separation of selected TKIs by CE-MS under optimal conditions. Based on the comparison of LOQ values with common levels of the TKIs in biological fluids, the method is suitable for the analysis of the TKIs in medicinal samples.