Number of the records: 1  

Physical localization of in silico identified tandem repeats by FISH in diploid Ae. umbellulata and Ae. comosa and their tetraploid hybrids

  1. Title statementPhysical localization of in silico identified tandem repeats by FISH in diploid Ae. umbellulata and Ae. comosa and their tetraploid hybrids [rukopis] / Jan Jurečka
    Additional Variant TitlesFyzická lokalizace in silico identifikovaných tandemových repetic diploidních Ae. umbellulata a Ae. comosa a jejich tetraploidních hybridů metodou FISH
    Personal name Jurečka, Jan, (dissertant)
    Translated titlePhysical localization of in silico identified tandem repeats by FISH in diploid Ae. umbellulata and Ae. comosa and their tetraploid hybrids
    Issue data2020
    Phys.des.55 s. (63 415 znaků) + 1 CD
    NoteOponent Mahmoud Ali Said ibrahim
    Ved. práce István Molnár
    Another responsib. Said ibrahim, Mahmoud Ali, (opponent)
    Molnár, István, (thesis advisor)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords Aegilops * pšenice * FISH * GISH * tandemové repetice * sondy * Aegilops * wheat * FISH * GISH * tandem repeats * probes
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languageangličtina
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00237137-465426482.pdf222 MB23.07.2020
    PosudekTyp posudku
    00237137-ved-660241513.pdfPosudek vedoucího
    00237137-opon-800816178.pdfPosudek oponenta

    Tato diplomová práce se zaměřuje na rod Aegilops, jeho genetickou příbuznost pšenici a evoluci genomů pšenice a Aegilops. Dále stručně popisuje metody křížení pšenice s cizím druhem, metody identifikace nepůvodních chromosomů a značení sond. Na konec popisuje princip identifikace tandemových repetic in silico, což sloužilo jako základ pro praktickou část. Praktická část se zabývá použítím nově identifikovaných randemových repetic jako prób u dvou diploidních druhů Ae. umbellulata a Ae. comosa, a také allotetraploidního hybrida Ae. biuncialis, jež nese stejné typy genomů. Na Ae. biuncialis bylá take provedena genomová in situ hybridizace na identifikaci genomového původu každého chromosomu. Ten samý experiment byl proveden na ampfiploidním hybridu pšenice a Ae. biuncialis, nicméně bez jakýhkoliv publikovatelných výsledků, a není tedy zahrnut v sekci Výsledky.This thesis focuses on the genus Aegilops, its genetic proximity to wheat and the evolution of wheat and Aegilops genomes. Furthermore, it briefly discusses methods of crossing wheat with alien species, alien chromosome identification and probe labelling. Lastly, it describes the process of in silico tandem repeat identification, which was the basis for the experimental part. The experimental part discusses use of newly identified tandem repeats as probes on two diploid species Ae. umbellulata and Ae. comosa, as well as on an allotetraploid hybrid Ae. biuncialis which shares their genome types. On Ae. biuncialis, genomic in situ hybridisation was also performed to identify the genomic origin of each chromosome. The same experiment has been performed on a Ae. biuncialis/Triticum amphiploid, however without any publishable results, therefore it is not included in the Results section.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.