Atypická myopatie (AM) je získané onemocnění pozorované u volně se pasoucích koní. Je způsobena otravou po požití nažek a semenáčků některých druhů javorů. Ty obsahují hypoglycin A (HGA) a také methylencyklopropylglycin (MCPG), jejichž metabolity mají inhibiční vliv na jednotlivé kroky -oxidace. Diplomová práce se zabývá analýzou vzorků krevních skvrn koní s podezřením na AM a kontrol. Do vyhodnocení byly zahrnuty také vzorky koní se zátěžovou myopatií. Metodou FIA-MS byly změřeny koncentrace acylkarnitinů a aminokyselin. Nejvíce diskriminujícími metabolity oddělující skupiny AM a kontrol byly C6, C8 a C8:1, v případě zátěžové myopatie byly tyto acylkarnitiny jen mírně zvýšeny. Analýza HGA, MCPG a jejich metabolitů byla provedena pomocí LC-MS/MS. U vzorků koní s AM se podařilo detekovat tři ze čtyř známých metabolitů. Od některých koní s AM byly k dispozici vícenásobné odběry vzorků krevních skvrn dokládající změny v metabolickém profilu v závislosti na průběhu onemocnění.Equine atypical myopathy (AM) is an acquired disease observed in free-grazing horses. It´s caused by poisoning after digestion of seeds and seedlings of some maple species. They contain hypoglycine A (HGA) and methylencyclopropylglycine (MCPG), whose metabolites have an inhibitory effect on individual steps in -oxidation. In the diploma thesis, the practical part is focused on analysis of blood spots samples of horses with suspected atypical myopathy and control groups. Samples of horses with exertional myopathy were also included in evaluation. Concentrations of acylcarnitines and amino acids were measured by FIA-MS. Most discriminatory metabolites dividing groups of AM and controls were C6, C8 a C8:1, in case of exertional myopathy these metabolites were slightly increased. Analysis of HGA, MCPG and their metabolites was performed by LC-MS/MS. Three of four known metabolites were detected in samples of horses with AM. There were multiple blood samples available from horses with AM, demonstrating changes in metabolic profile depending on the course of disease.