Number of the records: 1  

Využití systému CRISPR/Cas9 pro značení mitotických chromozomů v suspenzi

  1. Title statementVyužití systému CRISPR/Cas9 pro značení mitotických chromozomů v suspenzi [rukopis] / Lucie Dostálová
    Additional Variant TitlesVyužití systému CRISPR/Cas9 pro značení mitotických chromozomů v suspenzi
    Personal name Dostálová, Lucie, (dissertant)
    Translated titleCRISPR/Cas9 system for labeling mitotic chromosomes in suspension
    Issue data2020
    Phys.des.77 s. (87 235)
    NoteOponent Miroslav Valarik
    Ved. práce Petr Cápal
    Another responsib. Valarik, Miroslav (opponent)
    Cápal, Petr, (thesis advisor)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords CRISPR/Cas9 * průtoková cytometrie * CASFISH * CRISPR/Cas9 * flow cytometry * CASFISH
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00232658-772641783.pdf353.5 MB23.07.2020
    PosudekTyp posudku
    00232658-ved-250208960.pdfPosudek vedoucího
    00232658-opon-242589963.pdfPosudek oponenta

    Velikost rostlinných genomů je v rámci rostlinné říše velice variabilní. Jednou z příčin vysoké variability rostlinných genomů je skutečnost, že v průběhu evoluce bylo mnoho rostlinných druhů ovlivněno vnitrodruhovými nebo mezidruhovými hybridizacemi a polyploidizací, při níž dochází ke zdvojování sad chromozomů. Dalším důvodem, který přispívá k proměnlivosti je přítomnost rozdílného obsahu repetitivních sekvencí DNA, které se v genomu nachází. Mnoho hospodářsky významných plodin, jako například pšenice, ječmen či žito mají velké a komplexní genomy, což znesnadňuje a prodražuje jejich analýzu. Ta může být ale zjednodušena rozdělením genomu na jeho podjednotky - chromozómy pomocí metody průtokové cytometrie. Nicméně i třídění chromozomů je u mnohých rostlinných druhů komplikováno malými rozdíly v jejich velikosti DNA. Proto je snaha vyvinout různé alternativní přístupy pro značení chromozomů v suspenzi, které by mohli být do budoucna řešením tohoto problému. Jako jedna z možností se nabízí značení chromozómů v suspenzi metodou CASFISH, která používá systém CRISPR/Cas9 typu II z bakterie Streptoccocus pyogenes. Teoreticky je možné jej využít pro značení chromozomů, a to bez denaturace, která má negativní dopad na morfologii chromozomů.The size of plant genomes is very variable within the plant kingdom. One of the causes of high variability in plant genomes is that during evolution, many plant species were affected by intraspecific or interspecific hybridization and polyploidization, resulting in duplication of chromosome complement. Another reason contributing to variability is the presence of different content of repetitive DNA sequences present in the genome. Many economically important crops, such as wheat, barley and rye, have large and complex genomes, making it difficult and more expensive to analysis. A possible way to simplify their analysis is to divide their genomes into natural subunits - chromosomes. However, even the sorting of chromosomes is complicated by small differences in their DNA size in many plant species. Therefore, efforts are made to develop various alternative approaches for labelling chromosomes in suspension. A plausible alternative for chromosome labelling might be CASFISH. This method uses a CRISPR/Cas9 type II system from Streptoccocus pyogenes. Fluorescently labelled Cas9 construct can be used as a probe for labelling target DNA sequence without denaturation, which has a negative impact on chromosome morphology.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.