Number of the records: 1
Molekulárně biologická charakteristika zástupců rodu Badnavirus, čeleď Caulimoviridae
Title statement Molekulárně biologická charakteristika zástupců rodu Badnavirus, čeleď Caulimoviridae [rukopis] / Michaela Němcová Additional Variant Titles Molekulárně biologická charakteristika zástupců rodu Badnavirus, čeleď Caulimoviridae Personal name Němcová, Michaela, (dissertant) Translated title Molecular and biological characterisation of badnaviruses (genus Badnavirus), family Caulimoviridae Issue data 2020 Phys.des. 46 s. : il., tab. Note Oponent Milan Navrátil Ved. práce Dana Šafářová Another responsib. Navrátil, Milan (opponent) Šafářová, Dana (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords dsDNA virus * bez černý * detekce * PCR * Sanger sekvenování * fylogenetická analýza * dsDNA * elderberry * detection * PCR * Sanger sequencing * phylogenetic analysis Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00228586-899858304.pdf 61 1.2 MB 10.06.2020 Posudek Typ posudku 00228586-ved-258361524.pdf Posudek vedoucího 00228586-opon-682663458.pdf Posudek oponenta
Bakalářská práce charakterizuje zástupce rostlinných virů rodu Badnavirus, čeledi Caulimoviridae se zaměřením na jejich molekulární a biologické vlastnosti, a dále další zástupce rostlinných virů infikující bez černý (Sambucus nigra L.). Teoretická část nejprve shrnuje obecné poznatky o čeledi Caulimoviridae a následně se věnuje detailnější charakteristice rodu Badnavirus. Zaměřuje se na interakci badnavirů s hostitelskou rostlinou, je popsán okruh hostitelů, symptomy virové infekce a způsoby přenosu viru, a dále organizace genomu s důrazem na variabilitu čtecích rámců a porovnání jednotlivých druhů. Popisuje metody detekce založené na jejich molekulárních a serologických vlastnostech. V textu jsou charakterizovány i ssRNA viry infikující bez černý z čeledí Betaflexiviridae, Secoviridae a Tombusviridae. Praktická část je zaměřena na detekci nově zjištěného, doposud nepopsaného viru z rodu Badnavirus v souboru 96 vzorků planých a kulturních bezů černých původem z různých oblastí České republiky. Je porovnána genetická variabilita detekovaných izolátů, je provedena fylogenetická analýza a srovnání s dalšími zástupci rodu.This thesis focuses on plant viruses (genus Badnavirus, family Caulimoviridae), concentrating on molecular and biological characteristics of these viruses and the occurrence of one novel badnavirus in the Czech Republic. It further describes plant viruses infecting elderberry (Sambucus nigra L.) The theoretical part summarizes information about the family Caulimoviridae and further describes the genus Badnavirus and its members in detail. It is focused on host range, symptoms of infection, transmission, genome organization of these viruses with emphasis on its variability among the genus and detection methods. The text also characterizes ssRNA viruses of families Betaflexiviridae, Secoviridae and Tombusviridae infecting elderberry (Sambucus nigra L.). The experimental part is focused on the detection of a novel badnavirus in a set of 96 samples of wild and cultivated elderberry plants originating from various regions of the Czech Republic. The genetic variability of detected isolates is compared, phylogenetic analysis and comparison with other members of the genus are performed.
Number of the records: 1