Number of the records: 1  

Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u čápa bílého (Ciconia ciconia)

  1. Title statementCross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u čápa bílého (Ciconia ciconia) [rukopis] / Tereza Gajdošíková
    Additional Variant TitlesCross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u čápa bílého (Ciconia ciconia)
    Personal name Gajdošíková, Tereza, (dissertant)
    Translated titleCross-species amplification of microsatellites from Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in White Stork (Ciconia ciconia)
    Issue data2020
    Phys.des.45 s. + 0
    NoteVed. práce Petr Nádvorník
    Oponent Vladan Ondřej
    Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor)
    Ondřej, Vladan, 1975- (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords brodiví * Ciconia ciconia * čáp bílý * mikrosatelity * cross species PCR amplifikace * Ciconiiformes * Ciconia ciconia * White Stork * microsatellites * crossspecies PCR amplification
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00228279-246001715.pdf188645.2 KB24.07.2020
    PosudekTyp posudku
    00228279-ved-797812840.pdfPosudek vedoucího
    00228279-opon-112469071.pdfPosudek oponenta

    V teoretické části jsem se nejprve věnovala taxonomickému zařazením řádu brodiví do systému ptáků a jak se tento systém v minulosti vyvíjel. Uvedla jsem bližší charakteristiku řádu brodiví, čeledi čápovití a čápa bílého jako testovaného druhu. Dále jsem se věnovala obecné charakteristice mikrosatelitů jako takových, mikrosatelitům z řádu tučňáci a univerzálním ptačím mikrosatelitům. V poslední části jsem popsala způsoby hledání mikrosatelitových lokusů se zaměřením na cross-species PCR amplifikaci. V praktické části jsem testovala polymorfismus mikrosatelitových lokusů na genomické DNA 6 nepříbuzných jedinců čápa bílého s využitím 173 párů primerů, z nichž 113 bylo od zástupců z řádu tučňáci, 36 párů primerů bylo navržených pro amplifikaci EST ptačích mikrosatelitů a 24 párů primerů navržených pro amplifikaci konzervovaných ptačích mikrosatelitů. Těmito páry primerů jsem u 6 nepříbuzných jedinců čápa bílého detekovala celkem 19 polymorfních lokusů, z toho 9 polymorfních mikrosatelitů bylo navrženo pro mikrosatelity 6 druhů tučňáků a po 5 polymorfních mikrosatelitech navržených pro EST ptačí mikrosatelity a pro konzervované ptačí mikrosatelity.In the Theoretical Part, I commenced with the taxonomic categorization of the order Ciconiiformes into the avian system and its historical development. The closer characterisations of the order Ciconiiformes, Ciconiidae and White Stork respectively were provided. Furthermore, microsatellites in general, microsatellites in Sphenisciformes and universal avian microsatellites were characterised. In the last chapter, the methods for finding polymorphic microsatellite loci with the focus on crossspecies PCR amplification were described. In the Practical Part, I examined the polymorphism of microsatellite loci on genome DNA of 6 non-relative White Storks using 173 pairs of primers. Out of the 173 primers, 113 pairs were extracted from the order of Sphenisciformes, 36 pairs were intended for the amplification of EST avian microsatellites and 24 pairs were intended for the amplification of conserved avian microsatellites. Using the aforementioned pairs of primers, I detected an overall 19 polymorphic loci in 6 non-related White Storks. The 19 identified polymorphic loci consisted of 9 polymorphic microsatellites from the group of microsatellites of 6 Penguin species, 5 polymorphic microsatellites designed for EST avian microsatellites and 5 polymorphic microsatellites designed for conserved avian microsatellites.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.