Cílem této diplomové práce bylo zjistit adsorpční energie a preferenční orientace polárních a nepolárních molekul (aceton, acetonitril, benzen, cyklohexan, dichloromethan, dioxan, ethanol, ethylacetát a nitromethan) při reakci s 2D materiály (grafen, fluorografen a fosforen) pomocí teoretických výpočtů. Molekuly se na povrch adsorbovaly v množstvích od jedné do čtyř a sledovaly se adsorpční energie pro každou z nich. Následně byly zjištěny preferované orientace jednotlivých molekul na povrchu a také jejich vzájemné interakce při adsorpci více jak jedné molekuly. Polárnější molekuly ochotně tvoří klastry na povrchu, což ovlivní jejich orientaci a také výrazně zvýší adsorpční energii. U fosforenu dochází k orientaci molekul na povrch v závislosti na jeho zvrásnění, kde hlavní roli hraje "zigzag" hrana, podél které se molekuly velmi často orientují.The aim of this diploma thesis was to determinate adsorption energies and preferential orientations of polar and non-polar molecules (such as acetone, acetonitrile, benzene, cyclohexane, dichlomethane, dioxane, ethanole, ethyl acetate and nitromethane) in reactions with 2D materials (such as graphene, fluorographene and phosphorene) using theoretical calculations. 1-4 molecules were placed on the surface and the adsorbtion energies were calculated in each configuration. Moreover, the preferred orientations and mutual interaction of individual molecules on surface were identified. More polar molecules were readily forming clusters on surface, which affected their orientation and also distinctly increased the adsorption energies. In the case of phosphorene, the molecules are oriented to the surface depending on its puckered structure, where the zigzag edge played the main role and very often participated in the orientation of molecules.