Number of the records: 1  

Příprava a validace stabilních buněčných linií exprimujících fluorescenčně značený protein RNF168

  1. Title statementPříprava a validace stabilních buněčných linií exprimujících fluorescenčně značený protein RNF168 [rukopis] / Tereza Voltemarová
    Additional Variant TitlesPříprava a validace stabilních buněčných linií exprimujících fluorescenčně značený protein RNF168
    Personal name Voltemarová, Tereza, (dissertant)
    Translated titlePreparation and characterization of the stable cell lines expressing fluorescent protein-tagged RNF168
    Issue data2019
    Phys.des.59 : il., grafy, schémata, tab.
    NoteVed. práce Ján Gurský
    Oponent Pavel Moudrý
    Another responsib. Gurský, Ján (thesis advisor)
    Moudrý, Pavel, (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Centrum regionu Haná (degree grantor)
    Keywords RNF168 * ubiquitin * ubiquitin ligasa * RNF168 * ubiquitin * ubiquitin ligase
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBiotechnologie a genové inženýrství
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00254379-750142635.pdf242.2 MB06.05.2019
    PosudekTyp posudku
    00254379-ved-717944176.pdfPosudek vedoucího
    00254379-opon-532181721.pdfPosudek oponenta

    V teoretické části této práce jsou sepsány publikované poznatky o ubiquitinu a procesu ubiquitinace. Je zde uveden celý proces přenosu ubiquitinu na substrát včetně detailnějšího popsání hlavních typů enzymů zapojených v přenosu ubiquitinu. Další úsek teoretické části je věnován jednotlivým typům polyubiquitinových řetězců a jejich funkci v buňkách. Závěrečná pasáž teoretické části se zabývá proteinem RNF168, který je E3 ubiquitin ligasa. Je zde popsáno zapojení tohoto proteinu v opravách poškození DNA, při proteotoxickém stresu a jeho propojení s onemocněními člověka. Praktická část této práce je věnována tvorbě dvou stabilních buněčných linií, které by exprimovaly fluorescenčně značený protein RNF168. To zahrnuje optimalizaci metody transfekce, následnou optimalizaci selekce transfekovaných linií a ověření přítomnosti exogenního proteinu RNF168 v transfekovaných buňkách. I když všechny kroky, tedy optimalizace transfekce i selekce a ověření přítomnosti proteinu, byly úspěšné, k vytvoření stabilních linií nedošlo. Možnou hlavní příčinou, která vyplývá ze získaných výsledků, je pravděpodobná toxicita vysoké hladiny RNF168 pro buňky.Theoretical part of this thesis includes published information about ubiquitin and ubiquitination process. The complete process of ubiquitin transfer to substrate as well as detail information about main types of enzymes involved in this process is described. Middle section of theoretical part is devoted to individual types of polyubiquitin chains and their function in cells. Closing section of theoretical part deals with the RNF168 protein - E3 ubiquitin ligase. Participation of this protein in DNA damage response, in proteotoxic stress and its connection to human diseases are described here. The practical part of this thesis is focused on preparation of two stable cell lines expressing fluorescent protein-tagged RNF168. This includes optimization of transfection method, subsequent selection of transfected cell lines and verification of exogenous RNF168 protein presence in transfected cells. Although all these steps (optimization of transfection, selection and verification of protein presence) were successfully accomplished, stable lines have not been prepared. The main cause could be the possible toxicity of high level of RNF168, as can be concluded from our results.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.