Number of the records: 1
Příprava a validace stabilních buněčných linií exprimujících fluorescenčně značený protein RNF168
Title statement Příprava a validace stabilních buněčných linií exprimujících fluorescenčně značený protein RNF168 [rukopis] / Tereza Voltemarová Additional Variant Titles Příprava a validace stabilních buněčných linií exprimujících fluorescenčně značený protein RNF168 Personal name Voltemarová, Tereza, (dissertant) Translated title Preparation and characterization of the stable cell lines expressing fluorescent protein-tagged RNF168 Issue data 2019 Phys.des. 59 : il., grafy, schémata, tab. Note Ved. práce Ján Gurský Oponent Pavel Moudrý Another responsib. Gurský, Ján (thesis advisor) Moudrý, Pavel, (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Centrum regionu Haná (degree grantor) Keywords RNF168 * ubiquitin * ubiquitin ligasa * RNF168 * ubiquitin * ubiquitin ligase Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biochemie Degreee discipline Biotechnologie a genové inženýrství book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00254379-750142635.pdf 24 2.2 MB 06.05.2019 Posudek Typ posudku 00254379-ved-717944176.pdf Posudek vedoucího 00254379-opon-532181721.pdf Posudek oponenta
V teoretické části této práce jsou sepsány publikované poznatky o ubiquitinu a procesu ubiquitinace. Je zde uveden celý proces přenosu ubiquitinu na substrát včetně detailnějšího popsání hlavních typů enzymů zapojených v přenosu ubiquitinu. Další úsek teoretické části je věnován jednotlivým typům polyubiquitinových řetězců a jejich funkci v buňkách. Závěrečná pasáž teoretické části se zabývá proteinem RNF168, který je E3 ubiquitin ligasa. Je zde popsáno zapojení tohoto proteinu v opravách poškození DNA, při proteotoxickém stresu a jeho propojení s onemocněními člověka. Praktická část této práce je věnována tvorbě dvou stabilních buněčných linií, které by exprimovaly fluorescenčně značený protein RNF168. To zahrnuje optimalizaci metody transfekce, následnou optimalizaci selekce transfekovaných linií a ověření přítomnosti exogenního proteinu RNF168 v transfekovaných buňkách. I když všechny kroky, tedy optimalizace transfekce i selekce a ověření přítomnosti proteinu, byly úspěšné, k vytvoření stabilních linií nedošlo. Možnou hlavní příčinou, která vyplývá ze získaných výsledků, je pravděpodobná toxicita vysoké hladiny RNF168 pro buňky.Theoretical part of this thesis includes published information about ubiquitin and ubiquitination process. The complete process of ubiquitin transfer to substrate as well as detail information about main types of enzymes involved in this process is described. Middle section of theoretical part is devoted to individual types of polyubiquitin chains and their function in cells. Closing section of theoretical part deals with the RNF168 protein - E3 ubiquitin ligase. Participation of this protein in DNA damage response, in proteotoxic stress and its connection to human diseases are described here. The practical part of this thesis is focused on preparation of two stable cell lines expressing fluorescent protein-tagged RNF168. This includes optimization of transfection method, subsequent selection of transfected cell lines and verification of exogenous RNF168 protein presence in transfected cells. Although all these steps (optimization of transfection, selection and verification of protein presence) were successfully accomplished, stable lines have not been prepared. The main cause could be the possible toxicity of high level of RNF168, as can be concluded from our results.
Number of the records: 1