Vláknité sinice rodu Phormidium jsou vzhledem k jeho vysoké míře polyfyletismu taxonomicky velmi složitý rod. V posledních letech došlo ke kombinaci nových odvozených rodů, především na základě vyspělých molekulárních metod. Cílem této práce je vypracování rešerše na rod Phormidium a nově odvozených rodů, sběr vzorků a jejich zpracování v laboratoři. Vzorky byly sbírány v oblasti Vizovických vrchů, části Bílých Karpat, Svitavska a Olomoucka od října 2017 do listopadu 2018. Sebrané vzorky byly zpracovány v algologické laboratoři na Katedře botaniky PřF UP v Olomouci. Postupným dočišťováním byly připraveny jednotlivé kmeny. Pomocí mikroskopu byla sledována morfologická variabilita vláken, zejména šířka, přítomnost či nepřítomnost slizové pochvy, tvar apikální buňky a tvar vlákna. Některé zástupce rodu Phormidium a jeho odvozené rody bývá obtížné identifikovat do druhu na základě morfologických znaků. V současné době se často uplatňují molekulární metody. Vybrané izolované kmeny byly podrobeny proteomické analýze založené na hmotnostní spektrometrické metodě MALDI-TOF MS. Tato metoda se v současné době hojně využívá k identifikaci různých mikroorganismů a představuje jednu z možností rychlé, přesné a levné metody identifikace.Filamentous cyanobacteria of the genus Phormidium are taxonomically a very complex genus, according to its highly polyphyletic character. Recently, new derived genera were combined, based mainly on advanced molecular methods. The aim of this thesis is to write a review of the genus Phormidium and newly derived genera, to collect and process samples in the laboratory. Samples were collected from the area of Vizovické vrchy, a part of Bílé Karpaty and the regions of Svitavy and Olomouc from October 2017 to November 2018. Collected samples were processed in the algological laboratory at the Department of Botany of the Faculty of Science of the Palacký University in Olomouc. Strains were prepared by gradual purification. Morphological variability of filaments, especially the width, the presence or absence of sheath, the shape of apical cells and the shape of filaments, was assessed with the use of a microscope. Some representatives of the genus Phormidium and its derived genera are very difficult to identify at the species level based on morphological features. Recently, molecular methods are often used. Selected isolated strains underwent proteomic analysis based on massspectrometric method MALDI-TOF MS. This method is currently broadly used to identify different organisms and represents one of the fast, accurate and cheap methods of identification.