Number of the records: 1  

Fylogenetická analýza sekvencí z vybraných rodin aldehyddehydrogenas z nižších rostlin

  1. Title statementFylogenetická analýza sekvencí z vybraných rodin aldehyddehydrogenas z nižších rostlin [rukopis] / Šimon Pavlů
    Additional Variant TitlesFylogenetická analýza sekvencí vybraných rodin aldehyddehydrogenas z nižších rostlin
    Personal name Pavlů, Šimon, (dissertant)
    Translated titlePhylogenetic analysis of sequences of selected families of aldehyde dehydrogenase from lower plants
    Issue data2019
    Phys.des.57 s. : il., grafy, tab.
    NoteVed. práce David Kopečný
    Oponent David Zalabák
    Another responsib. Kopečný, David (thesis advisor)
    Zalabák, David (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords aldehyddehydrogenasa * BLAST * PhyML * metabolismus aldehydů * řasa * kapradina * fylogeneze * Aldehyde dehydrogenase * aldehyde metabolism * Algea * BLAST * Fern * phylogenesis * PhyML
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBioinformatika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00234398-937091030.pdf264.7 MB14.05.2019
    PosudekTyp posudku
    00234398-ved-117758066.pdfPosudek vedoucího
    00234398-opon-949062138.pdfPosudek oponenta

    Tato bakalářská práce se zabývá analýzou sekvencí aldehyddehydrogenas (ALDH) v nižších rostlinách - řasách a kapradinách. Teoretická část je zaměřena na rešerši současných poznatků o nadrodině rostlinných aldehyddehydrogenas. Výsledková část zahrnuje vyhledávání pomocí softwaru BLAST a identifikaci ALDH genů v genomech řas Klebsormidium nitens, Coccomyxa subellipsoidea a Chromochloris zofingiensis a genomu kapradiny Azolla filiculoides. Sekvence kódovaných proteinů byly rozřazeny dle schválené klasifikace do rodin a podrodin a byla provedena fylogenetická analýza příbuznosti ALDH z vybraných rodin s členy z vyšších rostlin, pomocí softwaru PhyML. Bylo zjištěno, že většina ALDH genů je v genomech řas přítomna v jedné kopii a u dvou řas byla zjištěna absence silně konzervovaného genu ALDH7. Dále byla zjištěna přítomnost ALDH genu, o kterém se předpokládalo, že je přítomen pouze ve vyšších rostlinách.This bachelor thesis deals with the analysis of aldehyde dehydrogenase (ALDH) sequences in lower plants - algae and ferns. The theoretical part is focused on research of current knowledge about plant aldehyde dehydrogenase. The results include BLAST search and identification of ALDH genes in the Klebsormidium nitens, Coccomyxa subellipsoidea and Chromochloris zofingiensis genomes and Azolla filiculoides genome. The sequences of the encoded proteins were classified according to the approved classification into families and subfamilies and phylogenetic analysis of ALDH affinity of selected families with members from higher plants was performed using PhyML software. Most of the ALDH genes were found to be present in one copy in algal genomes and the absence of a strongly conserved ALDH7 gene was found in two algae. Furthermore, the presence of the ALDH gene was found, that was supposed to be present only in higher plants.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.