Number of the records: 1
Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis
Title statement Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis [rukopis] / Lucie Šimková Additional Variant Titles Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis Personal name Šimková, Lucie (dissertant) Translated title Comparative analysis of Pachycladon exilis subgenomes Issue data 2019 Phys.des. 51 Note Ved. práce Jan Bartoš Oponent Radim Čegan Another responsib. Bartoš, Jan (thesis advisor) Čegan, Radim, (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Celogenomová duplikace * kolinearita * polyploidie * Pachycladon exilis * Whole genome duplication * polyploidy * collinearity * Pachycladon exilis Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biochemie Degreee discipline Bioinformatika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00226199-871924200.pdf 88 1.3 MB 13.05.2019 Posudek Typ posudku 00226199-ved-209513080.pdf Posudek vedoucího 00226199-opon-216101190.pdf Posudek oponenta
Pachycladon exilis je mesopolyploidní druh endemický na Novém Zélandě, který vznikl z allopolyploidního předka před asi 2 miliony let. V rámci diplomové práce byla provedena komparativní analýza P. exilis s Arabidopsis lyrata, byly porovnávány subgenomu v rámci P. exilis a následně provedena komparativní analýza se sestaveným transkriptomem Crucihimalaya himalaica. Podařilo se vytvořit metodiku pro identifikaci kandidátních subgenomů P. exilis a jejich přiřazení k rodičovským genomům.Pachycladon exilis is a mesopolyploid species, endemic in New Zealand with an allopolyploid origin. This diploma thesis focuses on a comparative analysis of P. exilis and Arabidopsis lyrata, a comparison of P. exilis subgenomes and comparative analysis with Crucihimalaya himalaica. The thesis provide a methodology for identification of candidate subgenomes of P. exilis and their assignment to a potential evolutionary parental genomes.
Number of the records: 1