Number of the records: 1  

Metabolomická analýza HeLa buněk defektních v purinové de novo syntéze

  1. Title statementMetabolomická analýza HeLa buněk defektních v purinové de novo syntéze [rukopis] / Dana Dobešová
    Additional Variant TitlesMetabolomická analýza HeLa buněk defektních v purinové de novo syntéze
    Personal name Dobešová, Dana (dissertant)
    Translated titleMetabolomic analysis of HeLa cells defective in purine de novo synthesis
    Issue data2019
    Phys.des.90 s. (120 314 znaků) : tab. + Seznam zkratek metabolitů
    NoteOponent Jitka Široká
    Ved. práce Lucie Mádrová
    Another responsib. Široká, Jitka (opponent)
    Mádrová, Lucie (thesis advisor)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords metabolismus a transport purinů * technika CRISPR/Cas9 * metabolomika * statistická analýza * identifikace metabolitů * purine metabolism and transport * CRISPR/Cas9 technique * metabolomics * statistical analysis * metabolite identification
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBiochemie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00225280-903973941.pdf05.8 MB31.12.2999
    PosudekTyp posudku
    00225280-ved-465992325.pdfPosudek vedoucího
    00225280-opon-817334621.pdfPosudek oponenta

    Tato diplomová práce byla zaměřena na analýzu metabolomického profilu HeLa buněčných linií upravených technikou CRISPR/Cas9 v rámci jednotlivých kroků purinové de novo syntézy (PDNS). Jedná se o první modely lidských buněk pro studium jak známých, tak i potenciálních poruch této metabolické dráhy. Dosud byly popsány dvě dědičné metabolické poruchy PDNS - deficit ADSL a AICA-ribosidurie. Pro experiment byla zvolena kombinace necílené a cílené metabolomické analýzy, která byla provedena pomocí ultraúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní detekcí. Získaná data byla statisticky vyhodnocena a biochemicky interpretována. K významným metabolitům všech defektních linií v porovnání s kontrolou se řadily především meziprodukty PDNS. Dále byly pozorovány změny v hladinách purinů, pyrimidinů, acylovaných karnitinů a metabolitů účastnících se jednouhlíkového metabolismu.This diploma thesis was focused on the analysis of metabolomic profile of CRISPR/Cas9 genome edited HeLa cell lines deficient in individual steps of purine de novo synthesis (PDNS). These are the first human cell models for the study of both known and potential disorders of this metabolic pathway. To date, two inherited metabolic disorders of PDNS have been identified - ADSL deficiency and AICA-ribosiduria. Combination of non-targeted and targeted metabolomic analysis was performed using ultra high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry. The obtained data were statistically evaluated and biochemically interpreted. Compared to controls, PDNS intermediates were among the most significant metabolites of all defective cell lines. Furthermore, changes were found in the levels of purines, pyrimidines, acylcarnitines and metabolites involved in one-carbon metabolism.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.