Number of the records: 1  

Počítačové simulace Na+/K+-ATPasy a jejích interakcí s malými molekulami

  1. Title statementPočítačové simulace Na+/K+-ATPasy a jejích interakcí s malými molekulami [rukopis] / Petra Čechová
    Additional Variant TitlesMolekulárně-dynamické simulace Na+/K+-ATPázy v membráně
    Personal name Čechová, Petra (dissertant)
    Translated titleMolecular Dynamics Simulations of Na+/K+-ATPase
    Issue data2018
    Phys.des.106 : il., grafy, schémata, tab.
    NoteVed. práce Martin Kubala
    Ved. práce Martin Kubala
    Another responsib. Kubala, Martin, 1977- (thesis advisor)
    Kubala, Martin, 1977- (školitel)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biofyziky (degree grantor)
    Keywords Na+/K+-ATPasa * sodno-draselná pumpa * membránové proteiny * molekulární dynamika * docking * molekulární dokování * flavonolignany * quinolinony * výpočetní biologie * Na+/K+-ATPase * sodium-potassium pump * membrane proteins * molecular dynamics * molecular docking * flavonolignans * quinolinones * computational biology
    Form, Genre disertace dissertations
    UDC (043.3)
    CountryČesko
    Languageangličtina
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitlePh.D.
    Degree programDoktorský
    Degree programFyzika
    Degreee disciplineBiofyzika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00196335-583884084.pdf3916.3 MB14.06.2018
    PosudekTyp posudku
    00196335-ved-421972400.pdfPosudek vedoucího
    00196335-opon-820711637.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00196335-prubeh-212767593.pdf01.09.200914.06.201830.08.2018S2

    Výpočetní biologie využívá znalostí struktury proteinu k vytvoření počítačového modelu, který pak slouží jako základ pro zkoumání vztahu mezi jeho strukturou a funkcí. Na+/K+-ATPasa je membránový protein, který udržuje rovnováhu iontů v buňce a je tak nezbytný pro správnou funkci lidského těla. Tato disertační práce se věnuje popisu Na+/K+-ATPasy pomocí dvou výpočetních metod. Molekulární dynamika je využita k popisu iontových cest, pohybu domén a vazbě nukleotidů. Molekulární dokování bylo použito k vysvětlení mechanismu účinku flavonolignanů a quinolinonů na tento protein.Computational biology utilises information of protein structure and build models that are used to study their structure-function relationship. Na+/K+-ATPase is a membrane protein essential to human body by maintaining ion balance in the cells. This thesis studies Na+/K+-ATPase by two computational methods - molecular dynamics to describe ion pathways, domain movements and nucleotide binding, and molecular docking to rationalise the interaction of flavonolignans and quinolinones with this protein.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.