Number of the records: 1
Počítačové simulace Na+/K+-ATPasy a jejích interakcí s malými molekulami
Title statement Počítačové simulace Na+/K+-ATPasy a jejích interakcí s malými molekulami [rukopis] / Petra Čechová Additional Variant Titles Molekulárně-dynamické simulace Na+/K+-ATPázy v membráně Personal name Čechová, Petra (dissertant) Translated title Molecular Dynamics Simulations of Na+/K+-ATPase Issue data 2018 Phys.des. 106 : il., grafy, schémata, tab. Note Ved. práce Martin Kubala Ved. práce Martin Kubala Another responsib. Kubala, Martin, 1977- (thesis advisor) Kubala, Martin, 1977- (školitel) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biofyziky (degree grantor) Keywords Na+/K+-ATPasa * sodno-draselná pumpa * membránové proteiny * molekulární dynamika * docking * molekulární dokování * flavonolignany * quinolinony * výpočetní biologie * Na+/K+-ATPase * sodium-potassium pump * membrane proteins * molecular dynamics * molecular docking * flavonolignans * quinolinones * computational biology Form, Genre disertace dissertations UDC (043.3) Country Česko Language angličtina Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Ph.D. Degree program Doktorský Degree program Fyzika Degreee discipline Biofyzika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00196335-583884084.pdf 40 16.3 MB 14.06.2018 Posudek Typ posudku 00196335-ved-421972400.pdf Posudek vedoucího 00196335-opon-820711637.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00196335-prubeh-212767593.pdf 01.09.2009 14.06.2018 30.08.2018 S 2
Výpočetní biologie využívá znalostí struktury proteinu k vytvoření počítačového modelu, který pak slouží jako základ pro zkoumání vztahu mezi jeho strukturou a funkcí. Na+/K+-ATPasa je membránový protein, který udržuje rovnováhu iontů v buňce a je tak nezbytný pro správnou funkci lidského těla. Tato disertační práce se věnuje popisu Na+/K+-ATPasy pomocí dvou výpočetních metod. Molekulární dynamika je využita k popisu iontových cest, pohybu domén a vazbě nukleotidů. Molekulární dokování bylo použito k vysvětlení mechanismu účinku flavonolignanů a quinolinonů na tento protein.Computational biology utilises information of protein structure and build models that are used to study their structure-function relationship. Na+/K+-ATPase is a membrane protein essential to human body by maintaining ion balance in the cells. This thesis studies Na+/K+-ATPase by two computational methods - molecular dynamics to describe ion pathways, domain movements and nucleotide binding, and molecular docking to rationalise the interaction of flavonolignans and quinolinones with this protein.
Number of the records: 1