Number of the records: 1
Využití lingvistických metod v molekulární fylogenetice
Title statement Využití lingvistických metod v molekulární fylogenetice [rukopis] / Hana Owsianková Additional Variant Titles Využití lingvistických metod v molekulární fylogenetice Personal name Owsianková, Hana (dissertant) Translated title The utilization of linguistic methods in molecular phylogenetics Issue data 2018 Phys.des. 71 s. : mapy, grafy, tab. Note Ved. práce Dan Faltýnek Ved. práce Vladimír Matlach Another responsib. Faltýnek, Dan, 1980- (thesis advisor) Matlach, Vladimír (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra obecné lingvistiky (degree grantor) Keywords biosemiotika * molekulární fylogenetika * lingvistické metody * Damerau-Levenshteinova vzdálenost * Bag-of-Words model * Malus * Brassica * biosemiotics * molecular phylogenetics * linguistic-like-tools * Damerau-Levenshtein distance * Bag-of-Words model * Malus * Brassica Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Filologie Degreee discipline Obecná lingvistika a teorie komunikace book
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00224029-363798261.pdf 43 2 MB 14.05.2018 Posudek Typ posudku 00224029-ved-513314960.pdf Posudek vedoucího 00224029-opon-993051970.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00224029-prubeh-241687810.pdf 05.04.2018 14.05.2018 19.06.2018 1 Hodnocení známkou
Diplomová práce předkládá biosémiotické koncepty založené na analogii přirozeného jazyka a DNA, které vychází z chápání sekvencí DNA jako textu. Hlavním tématem je využití lingvistických metod v bioinformatice, předně pak pro účely molekulárně fylo-genetických studií. Pro výzkumnou část je využita metoda Damerau-Levenshteinovy vzdálenosti a Bag-of-Words model. V prvním případě je testována hypotéza o příbuzenství druhu Malus domestica (jabloň domácí) a planého druhu Malus sieversii pocházejícího z oblasti Tyrkystánu v Centrální Asii. Druhý výzkum je zaměřen na mapo-vání vztahů hybridů ke svým progenitorům tvořících tzv. U-model rodu Brassica (bru-kev). Pro oba výzkumy jsou použity genetické markery, konkrétně nukleární ribozomální marker ITS1 5.8S ITS2 a chloroplastový marker maturáza K. Cílem práce je prezentovat lingvistické metody jako vhodný nástroj pro zkoumání fylogenetických vztahů na mezi-druhové úrovni.This diploma thesis presents biosemotic concepts based on the analogy of natural lan-guage and DNA, based on the understanding of DNA sequences as text. The main topic is the use of linguistic methods in bioinformatics, especially for molecular phylogenetic studies. For the research part, the Damerau-Levenshtein distance method and the Bag-of-Words model are used. In the first case, the hypothesis on the relation of Malus do-mestica (domestic apple tree) and the wild species Malus sieversii originating from the Tyrkystane area in Central Asia is tested. The second research is focused on the mapping of hybrids relations to their progenitors forming the so-called U-model of genus Brassi-ca. Genetic markers, namely the nuclear ribosomal ITS1 5.8S ITS2 marker and the chlo-roplast marker maturase K, are used for both studies. The aim of this paper is to present linguistic methods as a suitable tool for the research of phylogenetic relationships at the interspecific level.
Number of the records: 1