Number of the records: 1  

Ribozomální stres a aktivace p53

  1. Title statementRibozomální stres a aktivace p53 [rukopis] / Barbora Haroková
    Additional Variant TitlesRibozomální stres a aktivace p53
    Personal name Haroková, Barbora (dissertant)
    Translated titleRibosomal stress and activation of p53
    Issue data2018
    Phys.des.74 stran
    NoteOponent Ján Gurský
    Ved. práce Pavel Moudrý
    Another responsib. Gurský, Ján (opponent)
    Moudrý, Pavel, (thesis advisor)
    Another responsib. Laboratoř růstových regulátorů (degree grantor)
    Keywords Ribozomální stres * p53 * DDX56 * actinomycin D * U2OS * Ribosomal stress * p53 * DDX56 * actinomycin D * U2OS
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineExperimentální biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00220325-191788240.pdf1102.9 MB10.05.2018
    PosudekTyp posudku
    00220325-ved-718533113.docPosudek vedoucího
    00220325-opon-299536349.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00220325-prubeh-855655984.pdf30.01.201610.05.201807.06.20181Hodnocení známkou

    Předkládaná diplomová práce se zabývá ribozomálním stresem a aktivací p53. Pozornost je zaměřena zejména na protein DDX56, který je pravděpodobně zapojen do procesu sestavování 60S ribozomální podjednotky. Byla zkoumána souvislost proteinu DDX56 s ribozomálním stresem a aktivací p53, která nebyla do této doby detailně objasněna. Teoretická část obsahuje literární rešerši na téma ribozomální biogeneze, ribozomální stres a aktivace p53, dále je zde rozebrána problematika degradace ribozomálních proteinů a v neposlední řadě také RNA helikázy s důrazem na DEAD-box helikázy DDX56 a DDX51. V experimentální části bylo studováno chování proteinu DDX56 po navození ribozomálního stresu pomocí actinomycinu D o různých koncentracích (1 nM, 5 nM a 10 nM) a různé délce časového ovlivnění (3, 6 a 24 hodin) u buněčné linie U2OS a dále u linií HeLa, BJ a MRC-5. Byl testován účinek bortezomibu a UV záření na hladinu DDX56. Pomocí inhibitorů proteasomu, bortezomibu a MLN7243, byl zjišťován mechanismus destabilizace DDX56. Byly použity metody western blotting, imunofluorescenční analýza a siRNA transfekce. Výsledky vedou k závěru, že je protein DDX56 degradován po navození ribozomálního stresu pomocí actinomycinu D, a to pravděpodobně v proteasomu. Pomocí transfekce siDDX56 došlo k down-regulaci proteinu DDX56 a ke zvýšení hladiny p53. Předpokládáme, že nedostatek proteinu DDX56 může způsobit ribozomální stres a aktivaci proteinu p53, která je závislá na RPL11.This diploma thesis deals with ribosomal stress and activation of p53. Attention is especially directed to DDX56 protein, which is probably involved in the assembly of the 60S ribosomal subunit. The relationship of DDX56 protein with ribosomal stress and p53 activation, which has not yet been elucidated in detail, has been investigated. The theoretical part includes a literature review on the topic of ribosomal biogenesis, ribosomal stress and p53 activation, degradation of ribosomal proteins and RNA helicases emphasizing the DEAD-box helicases DDX56 and DDX51. In the experimental part, behavior of DDX56 protein after induction of ribosomal stress with actinomycin D at various concentrations (1 nM, 5 nM and 10 nM) and different duration of time (3, 6 and 24 hours) in the U2OS cell line and HeLa, BJ and MRC-5 lines was studied. The effect of bortezomib and UV radiation on the DDX56 level was tested. Using proteasome inhibitors, bortezomib and MLN7243, the DDX56 destabilization mechanism was investigated. Western blotting, immunofluorescence analysis and siRNA transfection were used. The results lead to the conclusion that DDX56 protein is degraded following the induction of ribosomal stress by actinomycin D, presumably via the proteasome pathway. After siDDX56 transfection DDX56 protein was silenced and p53 level was increased. We assume that lack of DDX56 protein can cause ribosomal stress and activation of p53 protein, which is dependent on RPL11.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.