Molekulově dynamické (MD) simulace mohou jako technika poskytující atomové a femtosekundové rozlišení poskytnout důležitý vhled do studovaných uhlíkových nano-alotropů. Pro získávání věrohodných výsledků z klasických MD simulací je zapotřebí používat správné a validované parametry silového pole. Tato diplomová práce se zabývá odvozením parciálních nábojů pro realistické modely různě funkcionalizovaných sférických uhlíkových teček. Získané náboje byly následně použity v MD simulacích uhlíkových teček, jejichž výsledky byly publikovány v časopise Journal of Chemical Theory and Computation. Následně byly testovány dostupné nevazebné parametry aromatických uhlíkových atomů, které se v současné době hojně používají v simulacích uhlíkových nano-alotropů. Vhodnost parametrů byla ověřována na základě experimentálně získaných adsorpčních entalpií.Molecular dynamics (MD) simulations provide simultaneously atomic and femtosecond resolutions and thus represent a useful tool for studying carbon nano-allotropes. Most essential and critical task is to use correct and validated parameters implemented in force field in order to get credible results from classic MD simulations. This master thesis is focused on deriving partial charges for realistic models of functionalized spherical carbon dots. The derived partial charges were subsequently used in MD simulations of carbon dots, whereby the results were published in Journal of Chemical Theory and Computation. Moreover, different non-bonded parameters of aromatic carbon atoms, which are commonly used in simulations of carbon nano-allotropes, were tested. Suitability of those parameters was verified based on experimentally obtained adsorption enthalpies.