Number of the records: 1  

Alternatívny zostrih génu CRE1/AHK4 v Arabidopsis thaliana

  1. Title statementAlternatívny zostrih génu CRE1/AHK4 v Arabidopsis thaliana [rukopis] / Martin Hudeček
    Additional Variant TitlesStudium alternativního sestřihu genu CRE1/AHK4 v Arabidopsis thaliana
    Personal name Hudeček, Martin, (dissertant)
    Translated titleStudy of the alternative splicing of CRE1/AHK4gene in Arabidopsis thaliana
    Issue data2017
    Phys.des.72 strán : il., grafy, schémata, tab. + 1 CD
    NoteVed. práce Ondřej Plíhal
    Oponent Ivan Luptovčiak
    Another responsib. Plíhal, Ondřej (thesis advisor)
    Luptovčiak, Ivan (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords alternatívny zostrih * Arabidopsis thaliana * AHK4 * cytokiníny * alternative splicing * Arabidopsis thaliana * AHK4 * cytokinins
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languageslovenština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00217598-406472942.pdf631.5 MB31.07.2017
    PosudekTyp posudku
    00217598-ved-280004346.pdfPosudek vedoucího
    00217598-opon-957322788.pdfPosudek oponenta

    Alternatívny zostrih zásadným spôsobom reguluje génovú expresiu, zvyšuje plasticitu transkriptómu a proteómu u eukaryot. Existuje viacero typov alternatívneho zostrihu s odlišným zastúpením u rastlín a živočíchov. U rastlín sa v najväčšej miere vyskytuje typ alternatívneho zostrihu zvaný zachovanie intrónu, kedy nedochádza k vystrihnutiu daného intrónu z pre-mRNA odpovedajúceho génu. Výsledkom toho môže byť napríklad posunutie čítacieho rámca, výskyt predčasného terminačného kodónu a následne nefunkčnosť prekladaného proteínu. Táto bakalárska práca je zameraná práve na tento typ alternatívneho zostrihu u génu CRE1/AHK4, kódujúceho cytokinínový receptor, ktorý je zodpovedný za prenos cytokinínového signálu cez membránu v modelovom organizme Arabidopsis thaliana. Tento gén vo svojej sekvencii obsahuje 9 intrónov a tak teoreticky môže vytvárať veľký počet mRNA foriem so zachovanými intrónmi. Cieľom tejto práce je nájsť takéto formy CRE1/AHK4 mRNA pomocou metódy semikvantitatívnej PCR a zistiť, či prítomnosť vybraných cytokinínov má pozitívny vplyv na ich tvorbu. Metódou semikvantitatívnej PCR bolo zistené, že skutočne dochádza k tvorbe jednotlivých foriem mRNA s jedným alebo viacerými zachovanými intrónmi a taktiež, že v prítomnosti cytokinínov dochádza k zvýšeniu ich tvorby.Alternative splicing fundamentally regulates gene expression, increasing the plasticity of transcriptome and proteome in eukaryotes. There are several types of alternative splicing with different distribution in plants and animals. In plants, the most common type of alternative splicing is intron retention, where the intron is not spliced from the pre-mRNA of the corresponding gene, resulting in a shift in the reading frame, premature termination codon and consequently malfunctioning of the truncated protein. This bachelor thesis is focused on this type of alternative splicing in CRE1/AHK4 gene wich encodes the cytokinin receptor, that is responsible for transferring the signal through the membrane in the model organism Arabidopsis thaliana. This gene contains 9 introns in its sequence and theoretically can produce a large number of retained intron mRNA forms. The aim of this work is to find such forms of CRE1/AHK4 using semiquantitative PCR and to determine whether the presence of chosen cytokinins has a positive effect on their production. By semiquantitative PCR method, it was found that mRNA forms with one or more retained introns are produced, and it was also demonstrated, that the presence of cytokinins increases their production.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.