Number of the records: 1
Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu
Title statement Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu [rukopis] / Lucie Kotková Additional Variant Titles Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu Personal name Kotková, Lucie (dissertant) Translated title Optimization of library technology for multi-parallel sequencing in the colorectal cancer diagnostics Issue data 2017 Phys.des. 94 s. Note Oponent Jiří Drábek Ved. práce Rastislav Slavkovský Another responsib. Drábek, Jiří, 1969- (opponent) Slavkovský, Rastislav (thesis advisor) Another responsib. Laboratoř růstových regulátorů (degree grantor) Keywords kolorektální karcinom * sekvenování nové generace (NGS) * multiparalelní sekvenování * anti-EGFR terapie * cetuximab * panitumumab * KRAS * NRAS * BRAF * Colorectal carcinoma * next generation sequencing (NGS) * multi-parallel sequencing * anti-EGFR therapy * cetuximab * panitumumab * KRAS * NRAS * BRAF Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Experimentální biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00214592-874247090.pdf 0 34 B 31.12.2999 Posudek Typ posudku 00214592-ved-232787663.pdf Posudek vedoucího 00214592-opon-720427357.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00214592-prubeh-960502145.pdf 22.08.2012 10.05.2017 08.06.2017 1 Hodnocení známkou
Personalizovaná terapie je pro pacienty s kolorektálním karcinomem velká naděje na prodloužení a zkvalitnění života. U pacientů indikovaných k léčbě inhibitory EGFR (cetuximab, panitumumab) je nezbytné znát mutační status genů KRAS a NRAS, které jsou markery negativní odpovědi na léčbu, a prognostického markeru BRAF. Komerčně dostupné diagnostické kity zaměřené na genotypizaci těchto genů založené na přístupech sekvenování nové generace se v současné době potýkají s dlouhým a finančně nákladným zpracováním jednoho vzorku. Příprava sekvenační knihovny probíhá typicky ve dvou až čtyřech krocích, což klade vyšší nároky na personál z hlediska času i rizika možných chyb. Nově vyvinutá metoda fastRAS umožňuje přípravu sekvenační knihovny v jednom kroku, je uživatelsky příjemnější, rychlejší než stávající metody, snižuje celkové náklady na genotypizaci jednoho vzorku a je dostatečně robustní pro zpracování bez nutnosti technických replikátů. Metoda prošla validací a byla akreditovaná pro diagnostickou praxi.Personalised therapy promises prolonged and better quality survival for patients with colorectal carcinoma. Mutation status of KRAS and NRAS genes is important in patients indicated for anti-EGFR treatment (cetuximab, panitumumab), because it predicts negative response to therapy. Mutational status of BRAF is considered to be a prognostic marker. Problems of commercialy available genotyping kits based on next generation sequencing approach are long and expensive processing of one sample. Peparation of sequencing library mostly takes from two to four steps which makes it time-consuming and it carries a high risk of possible mistakes. Newly developed fastRAS method enables one-step library preparation with less costs for genotyping one sample, it is more user friendly, faster comparing to standard methods and robust enough to process a sample without the need of technical replicates. The method had been validated and accredited for diagnostics.
Number of the records: 1