Number of the records: 1
Strukturní dynamika Twister ribozymu
Title statement Strukturní dynamika Twister ribozymu [rukopis] / Tereza Filipi Additional Variant Titles Strukturní dynamika Twister ribozymu Personal name Filipi, Tereza (dissertant) Translated title The structural dynamics of twister ribozyme Issue data 2016 Phys.des. 49 s. Note Ved. práce Pavel Banáš Another responsib. Banáš, Pavel (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (degree grantor) Keywords Twister ribozym * molekulární dynamika * ribozym * Twister ribozyme * molecular dynamics * ribozyme Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Chemie Degreee discipline Aplikovaná chemie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00214203-407476626.pdf 60 4.5 MB 04.05.2016 Posudek Typ posudku 00214203-ved-946584351.docx Posudek vedoucího 00214203-opon-561509014.pdf Posudek oponenta
Cílem předložené bakalářské práce bylo studium strukturní dynamiky Twister ribozymu za použití metod výpočetní chemie. Studie dynamiky může přiblížit mechanismus RNA katalýzy této nedávno objevené třídy ribozymů. Jako výchozí metoda byla zvolena molekulová dynamika. Simulace nám poskytly všeobecný náhled na chování studovaných struktur. Na základě tohoto náhledu a naměřených hodnot RMSd, dihedrálních úhlů a B-faktoru byly analyzovány veškeré zkoumané struktury.The aim of this bachelor thesis was study of structural dynamics of Twister ribozyme using computational chemistry. Study of dynamic can provide us a closer look at mechanism of RNA catalysis of this recently discovered class of ribozymes. We used molecular dynamics. Simulations gave us a general look at behavior of all studied structures. Based on this and other measured data (RMSd, dihedrals, B-factor) the structures were analyzed.
Number of the records: 1