Tato bakalářská práce se zabývá stanovením zásob uhlíku v nadzemní a podzemní biomase. Stanovení zásob uhlíku je prováděno pomocí metod dálkového průzkumu Země. Při výpočtech jsou použita družicová multispektrální a předzpracovaná lidarová data. Princip práce spočívá v hledání vhodných přístupů a algoritmů. Jako první je provedeno testování vybraných metod v regionálním měřítku. Následně dojde k porovnání výsledků všech testovaných metod. Tento postup vede k určení nejpřesnější a nejoptimálnější metody aplikovatelné pro rozsah České republiky. Stanovené výsledky mohou sloužit ke srovnání některých odhadů uhlíku, které již byly provedeny v minulosti. Případně mohou být také porovnány s budoucími odhady. V obou případech jsou tak výsledné hodnoty určitou kvantitativní evidencí zásob uhlíku. Porovnání výsledných hodnot uhlíku s budoucími odhady může být také důkazem toho, že lesy, vlivem zvýšené koncentrace oxidu uhličitého v atmosféře, dokáží zadržovat větší množství uhlíku, než tomu bylo v minulosti.This thesis deals with carbon stocks estimation of aboveground and belowground biomass. Estimation is performed with remote sensing methods. For the estimation in this thesis are used satellite multispectral data and pre-processed LIDAR data too. Principle of estimation of carbon stocks is finding the most suitable algorithm. First it's necessary to execute for the regional scale, then the results of tested methods are compared. This procedure leads to the determination of the most precision method for the national scale, in this case the Czech Republic. The results can be used for comparison of last estimates or future estimates. The resulting values can be a suitable evidence as the fact, that nowadays forests could sequestrate bigger amount of carbon than in past. It is caused due to bigger amount of carbon dioxide in atmosphere.