Cílem této diplomové práce bylo porovnat vývoj biofilmu na skleněných kuličkách o průměru 5 mm inkubovaných v sedimentu na dvou lokalitách vodního toku Sitka pomocí stanovených parametrů. Následně pak zjistit, zda existují vztahy mezi naměřenými hodnotami parametrů a naměřenými hodnotami teploty vody. Celý výzkum probíhal od prosince roku 2013 do prosince roku 2014. Uskutečnilo se celkem šest odběrů. Bylo stanovováno těchto šest parametrů biofilmu: (i) koncentrace polysacharidů, (ii) množství celkového oganického uhlíku, (iii) mikrobiální abundance, (iv) relativní zastoupení domény Archaea a metanogenních archeí, (v) biovolum (objem buňky) a (vi) biomasa. Během celé doby inkubace byla na obou lokalitách zaznamenávána teplota vody. Zkoumané parametry vykazovaly podobný růstový trend na obou lokalitách. Velký vliv na růst jednotlivých parametrů měla teplota vody. Významným výsledkem bylo prokázání závislosti hodnot biovolumu na teplotě vody a výskyt metanogenních archeí na obou lokalitách po prvním odběru. Nelze jednoznačně určit, na které lokalitě bylo více biofilmu nebo která byla pro jeho vývoj vhodnější. Lokality se však lišily teplotou vody, relativním zastoupením archeí včetně metanogenních archeí, mikrobiální abundancí a koncentrací polysacharidů.The aim of this thesis was, according to determined parameters, to compare a development of the biofilm on glass balls (diameter 5 mm) incubated in sediment at two localities of the Sitka stream. Subsequently was evaluated, if there are relations between measured values of the parameters and the measured water temperature. The research was carried out from December 2013 to December 2014. In total, six samplings took place. Six parameters of the biofilm were determined: (i) concentration of polysaccharides, (ii) total organic carbon, (iii) microbial abundance, (iv) relative representation of Archaea and methanogenic archaea, (v) biovolume (volume of a cell) and (vi) biomass. During the whole sampling period was measured a water temperature. The examined parameters showed a similar grow trend on the both localities. The growth of individual parameters was significantly influenced by the water temperature. Important results were proving of the relation of biovolume value to the water temperature and a finding of the methanogenic archaea on both localities after the first sampling. It cannot be positively ascertained, on which locality was higher amount of the biofilm or which locality could be more suitable for a development of the biofilm. However, the two localities differed in water temperature, relative representation of Archaea including methanogenic archaea, microbial abundance and concentration of polysaccharides.