Number of the records: 1  

Vliv rostlinných hormonů na alternativní sestřih

  1. Title statementVliv rostlinných hormonů na alternativní sestřih [rukopis] / Alena Dudková
    Additional Variant TitlesVliv rostlinných hormonů na alternativní sestřih
    Personal name Dudková, Alena (dissertant)
    Translated titleEffects of phytohormones on alternative splicing
    Issue data2015
    Phys.des.108 s. (142 770 znaků)
    NoteOponent Petr Džubák
    Ved. práce Barbora Nardelliová
    Another responsib. Džubák, Petr (opponent)
    Nardelliová, Barbora (thesis advisor)
    Another responsib. Laboratoř růstových regulátorů (degree grantor)
    Keywords sestřih pre-mRNA * alternativní sestřih * familiární dysautonomie * IKBKAP * cytokininy * kinetin * splicing of pre-mRNA * alternative splicing * familial dysautonomia * IKBKAP * cytokinins * kinetin
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineExperimentální biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00194146-175647362.pdf301.7 MB15.05.2015
    PosudekTyp posudku
    00194146-ved-766673542.docPosudek vedoucího
    00194146-opon-242332741.docPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00194146-prubeh-939957344.pdf22.08.201215.05.201511.06.20151Hodnocení známkou

    Poruchy sestřihu pre-mRNA jsou příčinou řady dědičných onemocnění. Jedním z nich je familiární dysautonomie (FD), senzorická neuropatie způsobená mutacemi genu IKBKAP. V důsledku mutace IVS20+6T>C dochází k tvorbě transkriptů bez exonu 20, které nejsou překládány ve funkční protein. Kinetin, fytohormon ze skupiny cytokininů, je schopen obnovit schopnost sestřihového aparátu rozpoznat exon 20 v přítomnosti mutace. Testovala jsem, zda tuto aktivitu nemají další přírodní cytokininy a syntetické deriváty kinetinu. Pomocí PCR po reverzní transkripci jsem sledovala vliv látek na koncentraci normální a patologické formy mRNA ve fibroblastech získaných z pacientů s FD. Mezi testovanými sloučeninami jsem identifikovala několik aktivních. Zjistila jsem také, že nízkomolekulární inhibitory některých proteinkinas regulujících sestřih pre-mRNA na aberantní sestřih IKBKAP nemají vliv. Součástí práce je i rešerše literatury o nízkomolekulárních modulátorech aberantního sestřihu.Hereditary disorders are often caused by aberrant splicing of pre-mRNA. Familial dysautonomia (FD), a senzoric neuropathy, is caused by mutations affecting splicing of IKBKAP gene. The IVS20+6T>C mutation leads to production of transcripts without the exon 20 which are not translated into functional protein. Kinetin, a phytohormone from cytokinin family, is able to restore the ability of the spliceosome to recognize the exon 20 in the presence of the mutation. In this thesis, I tested other natural cytokinins and synthetic kinetin derivatives to find out whether they also possess this activity. Reverse transcription followed by PCR was used to evaluate the effects of the compounds on concentrations of wild-type and pathological mRNA isoforms in fibroblasts derived from FD pacients. Several active compounds were identified using this approach. However, small-molecule inhibitors of certain protein kinases regulating pre-mRNA splicing didn't have any effect on the IKBKAP aberrant splicing.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.