Předložená diplomová práce je zaměřena na syntézu nových fluorescenčních značek obsahujících systém pyrimidin-rhodamin. Práce je členěna do dvou částí. První z nich, teoretická část, je věnována již známým fluorescenčním značkám, především pH indikátorům a multifunkčním sondám. Popsány jsou také mitochondrie jako potenciální cílové organely. V experimentální části jsou popsány vylepšené reakční podmínky vedoucí k výchozím derivátům pyrimidinu a také všechny modifikace vyzkoušené za účelem zlepšení vazby v buňce. Součástí práce je kapitola s fluorescenčními vlastnostmi všech cílových látek a také výsledky studie penetrace přes buněčnou membránu.The submitted diploma thesis is focused on development of new fluorescent probes containing pyrimidine-rhodamine B system. The diploma thesis is divided into two parts. The first one, theoretical part, is aimed to overview known fluorescent probes, such as pH indicators and multifunctional probes. There is also description of mitochondria as potencial target organels. The experimental part describes improved reaction conditions leading to the starting pyrimidine derivatives and also all modifications tried to improve binding within a cell. The work includes a chapter with fluorescent properties of target molecules and also results of penetration through the cell membrane study.