Diplomová práce analyzuje ochranu a dodržování práv cizinců v uprchlických centrech v České republice. Vymezuje právní rámec k této problematice se pojící, včetně vytyčení základní terminologie, kterou česká legislativa nepoužívá příliš přesně. V návaznosti na institut azylu rozebírá režimy ochrany podle zákona o azylu a popisuje správní řízení žádosti o azyl, z pohledu cizince i státních orgánů. V práci je upozorněno na zvlášť zranitelnou skupinu jedinců, jimiž jsou matky s dětmi a nezletilí cizinci přicházející do země bez doprovodu rodiče. Stejně tak jsou s vyšší pozorností chráněny zájmy rodiny. Ve stěžejní kapitole Azylová zařízení v České republice jsou všechny tři typy uprchlických center podrobeny zkoumání, do jaké míry jsou chráněna práva cizinců omezených na svobodě (v zajišťovacích a přijímacích zařízeních) a jaké možnosti mají cizinci ubytovaní v pobytových a integračních centrech. Jsou zde rozebrána práva a povinnosti, které cizincům vymezuje právní rámec, v následné konfrontaci se zprávami Veřejného ochránce práv, jenž v letech 2006 a naposledy 2010 podrobil šetření faktickou stránku v uprchlických centrech (zajišťovací a přijímací zařízení). Neziskový sektor hraje v této problematice nezanedbatelnou roli; činnosti neziskových organizací (s detailnějším příkladem na Organizaci pro pomoc uprchlíkům) lze rozdělit do dvou základních okruhů, jedná se o služby právní a sociální. Situace týkající se ochrany a dodržování práv cizinců v uprchlických centrech v České republice je srovnána s dalšími dvěma evropskými zeměmi, Maďarskem (které je svou geografickou polohou "hraniční zemí" mezi Evropskou unií a nečlenskými východními zeměmi) a Velkou Británií, která byla záměrně zvolena z důvodu všeobecného povědomí poměrně větší vyspělosti a odlišného právního systému (common law). Práce obsahuje úvahy de lege ferenda vázající se k této problematice, upozorňující na potřebu komplexnějšího a systematičtějšího monitorování míry dodržování práv cizinců, silnějšího finančního podpoření neziskového sektoru za účelem rozšíření personální složky a v neposlední řadě potenciální vytvoření pracovních skupin kanceláře Veřejného ochránce práv věnující se ochraně práv cizinců v centrech častěji než v horizontu několika let v rámci nárazových šetření.Thesis analyses the protection of human rights of immigrants in detention centers in Czech Republic. It defines the coherent legal frame including the fundamental related terminology. Nevertheless, the Czech legislature does not use the terminology in a proper and accurate way. According to the legal institute of asylum, thesis focuses on various regimes of the possible protection which the asylum act offers, from the both views, the view of state organs either from the view of the non-citizen. The more sensitive and vulnerable group of immigrants, families, mothers and children and children coming in the country unaccompanied are highlighted. The fundamental part of the thesis (chapter named Asylum centers in the Czech Republic) points to the immigration centers in Czech Republic and subjects the current situation to a broader research about the grade and level of protection of the immigrants´ rights. Potential possibilities the non-citizens have are confronted with ombudsman´s reports from the years 2006 and 2010. The non-governmental sector plays a very important role in Czech Republic, when about aims to protect the rights of incoming immigrants. Their agenda can be divided into a legal service and social service. I used the example of Organization for the Aim to Refugees to illustrate the general aims of the rights protection. The situation in Czech Republic will be compared to two another European states, Hungary and Great Britain. I have chosen Hungary because we can look at this country like at the "entrance to Europe" due to its geographical location. The example of Great Britain was used because of the different legal system (common law system) and to illustrate the similar situation (when about protection of noncitizens´ rights), despite the fact that there is sort of general idea of Great Britain being more developed in all areas of law in action. Thesis contains de lege ferenda ideas linked to this problematic, highlighting the need of more complex and systematic monitoring of the immigrants´ rights protection, the need of stronger financial support of the aims of non-governmental organizations from the state, in purpose to extend the personal element of these organizations.