Bakalářská práce se soustředí na výskyt významných virů třešní (Prunus avium L.) a višní (P. cerasus L.) v kulturním a planém patosystému. Teoretická část práce nejdříve stručně charakterizuje třešně a višně. Protože existuje velké množství virů třešní a višní, v práci jsou shrnuty informace pouze o virech, které byly detekovány v Evropě i v České republice (popř. hrozí jejich zavlečení do České republiky) a jsou potenciální hrozbou pro zdejší třešně a višně. Jedná se o Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Arabis mosaic virus (ArMV), Cherry green ring mottle virus (CGRMV), Cherry leaf roll virus (CLRV), Cherry mottle leaf virus (CMLV), Cherry necrotic rusty mottle virus (CNRMV), Cherry virus A (CVA), Little cherry-virus 1 (LChV-1), Little cherry virus 2 (LChV-2), Prune dwarf virus (PDV), Prunus necrotic ringpost virus (PNRSV), Plum pox virus (PPV) a Strawberry latent ringspot virus (SLRSV). Na závěr jsou popsány metody ochrany proti virovým infekcím a způsoby detekce virů. Experimentální část práce je zaměřena na detekci a identifikaci virů třešní a višní pomocí polyvalentní PDO nested RT-PCR, která je určena k detekci virů patřících do rodů Trichovirus, Capillovirus a Foveavirus. V rámci práce se podařilo detekovat Apple chlorotic leaf spot virus, Cherry necrotic rusty mottle virus a Cherry virus A.This bachelorś thesis is focused on the occurence of important viruses of sweet cherries (Prunus avium L.) and sour cherries (P. cerasus L.) in cultural and wild pathosystem. The theoretical part at first briefly characterizes cherries and sour cherries. Because so far many cherries and sour cherries viruses have been identified, it summarizes information only about viruses identified in Europe and Czech Republic (or about those that might be introducted into Czech Republic) and they might be a threat for local cherries and sour cherries. These are Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Arabis mosaic virus (ArMV), Cherry green ring mottle virus (CGRMV), Cherry leaf roll virus (CLRV), Cherry mottle leaf virus (CMLV), Cherry necrotic rusty mottle virus (CNRMV), Cherry virus A (CVA), Little cherry-virus 1 (LChV-1), Little cherry virus 2 (LChV-2), Prune dwarf virus (PDV), Prunus necrotic ringpost virus (PNRSV), Plum pox virus (PPV) and Strawberry latent ringspot virus (SLRSV). In conclusion there are described methods of protection against viral infections and virus detection methods. Experimental part of this thesis is focused on detection and identification of cherry and sour cherry viruses using polyvalent PDO nested RT-PCR, which is intended for detection of viruses belonging to the Trichovirus, Capillovirus and Foveavirus genera. It was managed to detect Apple chlorotic leaf spot virus, Cherry necrotic rusty mottle virus a Cherry virus A.