Předložená diplomová práce se zabývá testováním možností analýzy glykosaminoglykanů (dermatan a heparan sulfátu) v preparátu Sulodexid v biologických tekutinách metodou tandemové hmotnostní spektrometrie ve spojení s výsokoúčinnou kapalinovou chromatografií (LC-MS/MS). Práce je rozdělena do několika kapitol. V teoretické části jsou popsány biologické vlastnosti, struktura a možnosti analýzy nejvýznamnějších glykosaminoglykanů. Dále jsou v této kapitole popsány principy technik, které byly pro analýzu dermatan a heparan sulfátu použity. Experimentální část práce je věnována vývoji metody umožňující monitorování hladiny Sulodexidu v krevní plazmě a v moči. Byly testovány dva přístupy. První přístup byl založen na převedení dermatan a heparan sulfátu methanolýzou bezvodým roztokem kyseliny chlorovodíkové v methanolu na methylované disacharidy. Druhý postup vycházel z LC-MS/MS analýzy nederivatizovaného dermatan a heparan sulfátu.This diploma thesis is focused on possibilities of analysis of glycosaminoglycans (dermatan and heparan sulfate) in preparation Sulodexide in biological fluids by high performance liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). The thesis is divided into several chapters. The theoretical part describes structures, biological properties of the most important glycosaminoglycans and possible approaches for their analysis. Principles of particular analytical techniques are discussed as well. The experimental part of work is focused on development of method for monitoring the levels of Sulodexide in blood plasma and urine. Two approaches were tested. First approach is based on the conversion of dermatan and heparan sulfate by methanolysis with anhydrous solution of hydrochloric acid in methanol to appropriate methylated disaccharides. The second approach was based on measurement of underivatized dermatan and heparan sulfate.