Number of the records: 1  

Purifikace a charakterizace tRNA isopentenyltransferasy z kukuřice

  1. Title statementPurifikace a charakterizace tRNA isopentenyltransferasy z kukuřice [rukopis] / Ester Lasotová
    Additional Variant TitlesPurifikace a charakterizace tRNA isopentenyltransferasy z kukuřice
    Personal name Lasotová, Ester (dissertant)
    Translated titlePurification and characterization of the maize tRNA isopentenyl transferase
    Issue data2015
    Phys.des.73 s. + CD ROM
    NoteOponent Petr Galuszka
    Ved. práce Jitka Frébortová
    Another responsib. Galuszka, Petr (opponent)
    Frébortová, Jitka (thesis advisor)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords tRNA isopentenyltransferasa * ZmIPT10 * DMAPP * syntetický oligonukleotid tRNA s konsensuální sekvencí 17 nukleotidů * tRNA isopentenyl transferase * ZmIPT10 * DMAPP * synthetic 17-base tRNA oligonucleotide
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBiochemie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00186810-261172139.pdf171.9 MB30.04.2015
    PosudekTyp posudku
    00186810-ved-284986337.pdfPosudek vedoucího
    00186810-opon-277736879.docPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00186810-prubeh-453208971.docx01.09.201130.04.201525.05.20151Hodnocení známkou
    Call numberBarcodeLocationSublocationInfo
    DP-KBC/235 (PřF-KBO)3134517947PřF-HolicePřF, Knihovna Holice - skladIn-Library Use Only

    Enzym tRNA isopentenyltransferasa katalyzuje přenos isopentenylové skupiny z dimethylallyldifosfátu (DMAPP) na adenin specifické tRNA v pozici 37. Cílem diplomové práce bylo purifikovat a charakterizovat enzym tRNA-IPT z kukuřice, který je označován jako ZmIPT10. Fúzní protein byl exprimován z rekombinantního plasmidu pTYB12::ZmIPT10 v Escherichia coli. Izolovaný protein byl postupně purifikován na třech různých chromatografických kolonách. Aktivita enzymu byla stanovena pomocí metody HPLC spojené s UV a hmotnostním detektorem. Pro enzym ZmIPT10 bylo určeno pH optimum (pH 8,5). Bylo prokázáno, že enzym katalyzuje přenos DMAPP na syntetický oligonukleotid tRNA s konsensuální sekvencí 17 nukleotidů, který obsahoval všechny důležité konzervované strukturní prvky. Pro substrát DMAPP byla stanovena Michaelisova konstanta 124 moll-1. Pro syntetický substrát tRNA o sekvencí 17 nukleotidů se Michaelisovu konstantu nepodařilo určit. Aktivita enzymu nebyla prokázána pro hydroxymethylbutenyldifosfát a mutanty syntetického tRNA oligonukleotidu A36G, A37G a A38G. Další studie by se měly podrobněji zaměřit na charakterizaci enzymu ZmIPT10 vzhledem k substrátové specifitě a určení Michaelisových konstant pro substráty.tRNA isopentenyl transferase catalyzes transfer of the isopentenyl moiety from dimethylallyl diphosphate (DMAPP) to adenine at position 37 of certain tRNAs. The aim of this work was to purify and characterize the tRNA-IPT from maize (Zea mays) that is named as ZmIPT10. The fusion protein was expressed from a recombinant plasmid pTYB12::ZmIPT10 in Escherichia coli. The isolated protein was purified on three different chromatographic columns. The enzyme activity was determined using HPLC method with UV and mass detection. The pH optimum of ZmIPT10 was determined to be pH 8,5. The enzyme catalyzes transfer of DMAPP to a synthetic 17-base tRNA oligoribonucleotide in which all known conserved structural features were present. Michaelis constant for DMAPP is 124 moll-1. Michaelis constant for synthetic 17-base tRNA oligoribonucleotide could not be determined. The enzyme activity was not confirmed for hydroxymethylbutenyl diphosphate and three mutant forms of 17-base tRNA oligoribonucleotide A36G, A37G and A38G. Further studies will focus on detailed ZmIPT10 characterization with respect to substrate specificity and determination of Michaelis constants for specific substrates.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.