Epifyton je jedním z perifytických společenstev eufotické vrstvy vodních ekosystémů. Zahrnuje rozličné ekologické i taxonomické skupiny organismů tvořící nárosty na ponořených rostlinných substrátech. V této práci byla srovnávána společenstva epifytických rozsivek různých makrofytických substrátů na dvaceti šesti lentických a lotických lokalitách okresu Svitavy. Vzorky vodních rostlin s rozsivkovými nárosty byly odebírány během čtyř ročních období během let 2012 a 2013. Prostřednictvím determinace, semikvantitativního vyhodnocení a vícerozměrné statistické analýzy byla prozkoumána diverzita, druhové složení a ekologické preference uvnitř společenstev. Rozdíly v druhové diverzitě stojatých a tekoucích vod nebyly signifikantní. Byly zjistěny rozdíly v druhovém složení rozsivek tekoucích vod, stojatých vod bez okřehku a stojatých vod s okřehkem. Rostlinný substrát, zejména okřehek a vrba měly signifikantní vliv na druhové složení epifytonu. Z nalezených druhových komplexů byl pro další studium vytipován okruh rodů Fragilaria sensu lato.Epiphyton is one kind of periphytic assemblages living in euphotic zone of aquatic ecosystems. It consists of variable ecological and taxonomical groups of organisms attached to submerged plant substrata. In this thesis the epiphytic diatom assemblages on different kinds of macrophytic substrata were compared within twenty-six lentic and lotic locations of Svitavy region. Samples of aquatic plants with diatomic mats were collected in four seasons of 2012 and 2013. The diversity, species composition and ecological preferences within the sampled assemblages were investigated on species level using semi-quantitative evaluation and multivariate statistical analysis. Differences in species diversity between streams and ponds were not significant. On the other hand differences were found in species composition. Moreover significant influence of substrate, particularly Lemna and Salix were confirmed. Future research will continue on species complexes Fragilaria sensu lato.