Předkládaná diplomová práce se zabývá konflikty ekonomického rozvoje v rámci chráněných oblastí soustavy Natura 2000, jakožto jednak jejím složením, právním základem, ale především vztahem soustavy s rozvojem ekonomických aktivit. Její úvodní kapitola se především snaží popsat vývoj environmentální politiky EU a popsat její základ v komunitárním právu. Druhá kapitola následně popisuje složení Natury 2000, neboli prostředku ochrany životního prostředí na úrovni Evropské unie a právní ukotvení soustavy v právním systému EU. Třetí kapitola se zaměřuje na problematiku členských států při transpozici jednotlivých právních ustanovení do vnitrostátních právních systémů. Čtvrtá kapitola se zaměřuje na roli Soudního dvora EU v případech týkajících se Natury 2000 a poslední pátá kapitola probírá jednotlivé případy z různých členských zemí, kdy se snaží analyzovat skutkové podstaty jednotlivých případů konfliktů ekonomických aktivit. Na základě tohoto rozboru je následně podán obraz možného ekonomického rozvoje lokalit, jenž je vždy posuzován podle jednotlivých okolností a kritérií.Essential goal of this thesis is set for describing certain environmental conflicts where there is on one side EU environmental approach represented by nature conservation network Natura 2000 and on the other side economic development of the area. The first chapter deals with describing environmental policy of the EU and its legal provisions in acquis communautaire. The second chapter follows with describing of Natura 2000 network as a mean of nature conservation policy with its legal provisions in the EU law. The third chapter focuses on transposition and implementation of Natura's law provisions into the EU member state's legal systems. The fourth chapter concentrates on a role of Court of Justice of the EU in Natura 2000 cases and is followed with final the fifth chapter that looks into various law cases that deal with nature conservation conflicts against economic development. The means of analyzing those law cases are chosen through description and picking up relevant data. On basis of those data there's given image of what would be the limits of economic development of the certain areas.