Number of the records: 1  

Studium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací

  1. Title statementStudium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací [rukopis] / Petra Čechová
    Additional Variant TitlesStudium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací
    Personal name Čechová, Petra (dissertant)
    Translated titleMolecular dynamics studies of Na+/K+-ATPase
    Issue data2013
    Phys.des.41s : il., grafy, tab.
    NoteVed. práce Martin Kubala
    Oponent Petr Jurečka
    Another responsib. Kubala, Martin, 1977- (thesis advisor)
    Jurečka, Petr (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biofyziky (degree grantor)
    Keywords N/K ATPasa * DPPC * DSPC * POPE * MARTINI * molekulární dynamika * N/K ATPase * DPPC * DSPC * POPE * MARTINI * molekular dynamics
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programFyzika
    Degreee disciplineMolekulární biofyzika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00184032-795081958.pdf272.8 MB26.04.2013
    PosudekTyp posudku
    00184032-ved-490032692.pdfPosudek vedoucího
    00184032-opon-147492244.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00184032-prubeh-940111695.pdf23.10.201226.04.201317.05.20132Hodnocení známkou

    Tato diplomová práce využívá metod výpočetní chemie ke zkoumání chování Na+/K+-ATPasy. Pomocí silového pole MARTINI je vytvořen model tohoto proteinu v membránách složených z různých lipidů (DSPC, DPPC, POPE), na kterém je následně pomocí molekulární dynamiky provedena simulace jeho chování po dobu 1 ?s. U takto získaných dat jsou pak sledovány konformační změny proteinu, pohyb iontů a rozložení lipidů v membráně.This thesis uses computational chemistry methods to study the behavior of Na+/K+-ATPase. Using MARTINI force field, we model the protein in membranes consisting of different lipids (DSPC, DPPC, POPE). The behavior of system on the timescale of 1 ?s is then simulated by using molecular dynamics. Obtained data are analysed with respect to conformational changes of the protein, ion movement and radial distribution of lipid molecules in the membrane.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.