Number of the records: 1
Metylační status vybraných genů u sporadických forem kolorektálního karcinomu
Title statement Metylační status vybraných genů u sporadických forem kolorektálního karcinomu [rukopis] / Hana Dvořáková Additional Variant Titles Metylační status vybraných genů u sporadických forem kolorektálního karcinomu Personal name Dvořáková, Hana (dissertant) Translated title Methylation status of selected genes in sporadic forms of colorectal cancer Issue data 2014 Phys.des. 64s (120 358 znaků) : il., grafy, schémata, tab. Note Oponent Tomáš Gucký Ved. práce Boris Cvek Another responsib. Gucký, Tomáš (opponent) Cvek, Boris, 1976- (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords Kolorektální karcinom * epigenetika * DNA metylace * mikrosatelitová nestabilita * Colorectal cancer * epigenetics * DNA methylation * microsatellite instability Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00179344-242952591.pdf 62 3.7 MB 28.04.2014 Posudek Typ posudku 00179344-ved-690383532.pdf Posudek vedoucího 00179344-opon-696905574.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info DP-KBB/133 (PřF-KBO) 3134516889 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Kolorektální karcinom (CRC) je ve světě i v České republice jedním z nejčastějších nádorových onemocnění. V celosvětovém měřítku je Česká republika ve výskytu této diagnózy u mužů na třetím a u žen na druhém místě. CRC je výsledkem akumulace mnoha genetických a epigenetických změn, postihující epiteliální buňku, které se objevují na úrovni chromozomů a DNA. Tento vícekrokový proces je charakterizován inaktivací tumor-supresorů, aktivací proto onkogenů nebo deficiencí "mismatch-repair" genů. Výsledkem je nekontrolovatelné dělení buněk s vysokou invazivitou a zakládáním metastáz. Diplomová práce se zabývá sledováním metylačního stavu genů: MLH1, APC, p16, MGMT a vybraných MINT lokusů. Provedena byla analýza souboru 100 pacientů, jejichž nádorová tkáň pochází z Komplexního onkologického centra, Nový Jičín. Práce zahrnuje izolaci DNA, bisulfitovou konverzi, metyl-senzitivní polymerázovou řetězovou reakci (MS-PCR), real-time PCR, gelovou a čipovou separaci PCR produktů. U studovaných genů se metylace promotoru vyskytovala v následujícím zastoupení: MLH1 (37%), APC (37%), p16 (22%), MGMT (41%). Studované MINT lokusy byly metylovány v přilehlých CpG oblastech takto: MINT1 (14%), MINT17 (10%), MINT31 (15%). Doplňkem práce bylo stanovení globálně metylačního stavu nádorového genomu, který se ukázal jako hypometylovaný, s poklesem 5 metylcytosinu o 19% oproti zdravé tkáni. Práce byla realizována z grantových prostředků, provedena byla v Laboratoři lékařské genetiky - Úsek molekulární biologie, Laboratoře Agel a.s. Nový Jičín.Colorectal carcinoma (CRC) is the most common cancerous disease in the world and also in the Czech Republic. Male in the Czech Republic afflicted by this disease are put on the second position and female on the third position when compared to the whole world. The CRC is result of accumulation of a lot of genetic and epigenetic changes which are developed in epithelial cells. The inactivation of tumour-suppressors, the activation of oncogenes and the deficiency of mismatch-repair genes is essential for this multistep process of CRC carcinogenesis. The result of these actions is an uncontrolled proliferation with high invasion and production of metastasis. The base of the diploma thesis deals with methylation status of genes: MLH1, APC, p16, MGMT a selected MINT loci. The group of 100 patients from Comprehensive oncology centre in Nový Jičín were analysed by isolating their tumour tissues. The methods which were used in the thesis include DNA isolation, bisulfide conversion, methyl sensitive PCR (MS-PCR), real time PCR, the gel or chip separation of PCR products. The methylation of CpG island of genes/loci was detected in this frequency: MLH1 (37%), APC (37%), p16 (22%), MGMT (41%), MINT1 (14%), MINT17 (10%), MINT31 (15%). The extension of this thesis was global methylation detection in tumour genome. The tumour genome was hypomethylated, The 5 methylcytosin was decreased by19% in comparison with healthy tissue. This thesis was supported from the grant funds. It was created in Laboratory of medical genetics, Department of molecular biology, Agel Laboratories Nový Jičín.
Number of the records: 1