Number of the records: 1
Substrátová specifičnost a imobilizace rostlinných aminoaldehyddehydrogenas
Title statement Substrátová specifičnost a imobilizace rostlinných aminoaldehyddehydrogenas [rukopis] / Jan Frömmel Additional Variant Titles Substrátová specifičnost a imobilizace rostlinných aminoaldehyddehydrogenas Personal name Frömmel, Jan (dissertant) Translated title Substrate specificity and immobilization of plant aminoaldehyde dehydrogenase Issue data 2014 Phys.des. 92 stran + 52 stran příloh Note Ved. práce Marek Šebela Another responsib. Šebela, Marek, 1971- (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Aminoaldehydy * Aminoaldehyddehydrogensa * substrátová specifičnost * imobilizace enzymu * Aminoaldehydes * aminoaldehyde dehydrogenase * substrate specificity * enzyme immobilization Form, Genre disertace dissertations UDC (043.3) Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Ph.D. Degree program Doktorský Degree program Biochemie Degreee discipline Biochemie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00143289-525058909.pdf 82 14.7 MB 20.10.2014 Posudek Typ posudku 00143289-opon-385572118.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00143289-prubeh-675662579.pdf 01.09.2010 20.10.2014 10.11.2014 S 2 Call number Barcode Location Sublocation Info DIS/164 (PřF-KBO) 3134515127 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Rostlinné aminoaldehyddehydrogenasy (AMADH) katalyzují oxidaci -aminoaldehydů na aminokyseliny s redukcí koenzymu NAD+. V rámci aldehyddehydrogenas (ALDH) se řadí do rodiny ALDH10 spolu s bakteriálními avšak mimo živočišné AMADH, které tvoří rodinu ALDH9. Díky široké substrátové specifičnosti se rostlinné AMADH podílí na řadě metabolických drah, kam patří degradace polyaminů, tvorba osmoprotektantů, popř. syntéza karnitinu z lysinu. Jde o homodimerní či homotetramerní proteiny s aktivním místem tvořeným Cys, Asn a Glu. Nejobvyklejším substrátem je 3-aminopropanal (APAL), ovšem oxidují i další přirozené aminoaldehydy: 4-aminobutanal (ABAL), 4-(trimethylamino)butanal, 4-guanidinobutanal, 4-(3-aminopropylamino)-butanal či betainaldehyd. V disertační práci byla studována substrátová specifičnost isoenzymů z hrachu (PsAMADH1 a 2) a rajčete (SlAMADH1 a 2). Vzhledem k heterocyklickým aldehydům vykazuje nejšiřší substrátovou specifičnost SlAMADH1. Pyridinkarbaldehydy jsou slabšími substráty než pyridinylpropanaly. Oxidace halogenderivátů 4-pyridinkarbaldehydu a benzaldehydu probíhá pouze tam, kde se substituce nenachází ve vicinální poloze vzhledem k aldehydové skupině. -(Pyridinylmethylamino)butanaly jsou výrazně lepšími substráty než -(pyridinylmethylamino)propanaly. Acylaminoaldehydy jsou substráty obou PsAMADH, přičemž deriváty APALu jsou lepší než příslušné deriváty ABALu. Aldehydy vyskytující se v lihovinách se předpokládaly jako substráty SlAMADH1. Enzym byl imobilizován na nanočástice z maghemitu. Takto upravené nanočástice byly vloženy do mikroelektrochemické cely s elektrodami z platiny, Ag/AgCl a uhlíkové pasty s obsahem maghemitových nanočástic, kde byly fixovány pomocí externího magnetu. Po přídavku vzorku lihoviny do elektrochemické cely a reakci byla měřena koncentrace vzniklého NADH lineární voltametrií. Biosenzor lze použít ke stanovení obsahu aldehydů v lihovinách, ale nelze s jeho pomocí určit přesné zastoupení jednotlivých aldehydůPlant aminoaldehyde dehydrogenases (AMADH) catalyze the oxidation of -aminoaldehydes to amino acids using NAD+ as a coenzyme. Within the aldehyde dehydrogenase (ALDH) superfamily, they belong to the ALDH10 family together with bacterial AMADHs but separately from mammalian enzymes forming the ALDH9 family. Their substrate specificity is very broad. AMADH participate in many metabolic pathways such as polyamine degradation, production of osmoprotectants or synthesis of carnitine. Plant AMADHs are homodimeric or homotetrameric proteins. The active site is formed by Cys, Asn and Glu. The most common natural substrate is 3-aminopropanal (APAL) but other natural aminoaldehydes are accepted as well. This thesis has been devoted to studying the substrate specificity of AMADH isoenzymes from pea (PsAMADH1 and 2) and tomato (SlAMADH1 and 2). SlAMADH1 has the broadest specificity towards heterocyclic aldehydes. Pyridine carbaldehydes are weaker substrates than pyridinyl propanals. Only halogenderivates of 4-pyridinylcarbaldehyde or benzaldehyde, which do not contain the substitution at the vicinal position to the aldehyde group, are oxidized. -(Pyridinylmethylamino)butanals are better substrates than -(pyridinylmethylamino)propanals. N-acyl--aminoaldehydes are subtrates of both PsAMADHs. APAL derivates are better substrates than the respective ABAL derivates. Aldehydes occuring in spirits were expected as substrates of SlAMADH1. In order to construct a biosensor, SlAMADH1 was immobilized on maghemite nanoparticles. Immobilized enzyme was placed into a microelectrochemical cell and fixed by an external magnet. The cell contained three electrodes produced from platinum, Ag/AgCl or carbon paste containing maghemite nanoparticles. After adding a sample of spirit and reaction, the concentration of NADH was meassured by linear sweep voltametry. The biosensor is usable to determaine the total concentration of aldehydes in spirits, but i tis not able to provide an information on the quantity of any single adehyde.
Number of the records: 1