Cytokininy jsou přirozeně se vyskytující skupina rostlinných hormonů. Z chemického hlediska jde o N6 substituované deriváty adeninu, přičemž v poloze N6 se nachází isoprenoidní nebo aromatický postranní řetězec. V rostlinném organismu plní cytokininy funkci regulátorů buněčného cyklu a podílejí se na významných vývojových procesech. Jejich koncentrace se pohybuje v rozmezí fmol-pmol/g čerstvé rostlinné hmoty. Biologická aktivita fytohormonů je úzce spjata s jejich chemickou strukturou. Jedna z metod kapilární elektroforézy (CE) - micelární elektrokinetická chromatografie (MEKC) ? ve spojení s detekcí na základě laserem indukované fluorescence se jeví jako vhodná metoda pro separaci cis/trans izomerů fluorescenčně značených nukleotidů zeatinu a stanovení jejich poměru ve vzorku.Cytokinins are a group of naturally occuring plant hormones. From a chemical point of view cytokinins are N6 substitued derivates of adenin with isoprenoid or aromitacal side chain in N6 position. In plant oraginsm cytokinins fulfils the function as a cell cycle and important developmental processses regulators. Their concentration varies between fmol-pmol/g of a fresh weight. The biological activity of phytohormones is closely related to their chemical structure. One of the method of capillary electrophoresis (CE) ? micellar electrokinetic capillary chromatography (MEKC) ? with detection based on laser induced fluorescence appears to be suitable for separation of cis/trans fluorescence labeled zeatin nucleotides izomers and determination of their ratio in the sample.