Metylácia DNA katalyzovaná DNA metyltransferázami je epigenetickou modifikáciou DNA, ktorá obvykle súvisí s potlačením transkripcie, pokiaľ je prítomna v promotorovej oblasti príslušného génu. Naproti tomu acetylácia histónov je spojovaná s aktiváciou transkripcie, pričom hypoacetylácia histónovými deacetylázami s metyláciou promotorových CpG ostrovčekov alebo metyláciou histónových lyzínov môže mať vplyv na expresiu tumor supresorových génov alebo inhibítorov cyklin-dependentných kináz. V tejto práci bol sledovaný vplyv inhibítorov histónových deacetyláz a metylácii DNA na prostatické nádorové bunkové línie, a to western blotovou analýzou expresia HDAC2 a HDAC3, pomocou PCR zmeny v expresii DNA metyltransferáz DNMT1 a DNMT3b na histónoch H3 a H4, po izolácii DNA, ktorá bola precipitovaná protilátkami proti Acetyl-histone H3 a Acetyl-histone H4.DNA methylation catalyzed by DNA methyltransferases is an epigenetic modification of DNA associated with trancriptional repression when is present in the gene promoter region. Histone acetylation is correlated with transcriptional activation. Hypoacetylation of histones deacetylases with methylation of promoter CpG islands or methylation of histones lysines can influence an expression of the tumour suppressor genes or the inhibitors cyclin-dependent kinases. In this thesis we detected influence of histone deacetylases inhibitor and DNA methylation in prostate cancer cell lines, expression of HDAC2 and HDAC3 by western blot analysis. We detected expression of DNA methyltransferases DNMT1 and DNMT3b at histones H3 and H4 after isolation of DNA immunoprecipitated with Anti-acetyl-histone H3 Anti-acetyl-histone H4 and by PCR method.