Předmětem bakalářské práce jsou kontrolní systémy ve školství se zaměřením na hospodaření středních škol. Teoretická část práce vymezuje základní pojmy z oblasti hospodaření středních škol a kontrolních činností týkajících se finančních kontrol. Praktická část je rozdělena na dvě části. První část je zaměřena na dotazníkové šetření s cílem ověřit realizaci finanční kontroly v praxi a její přínos. Ve druhé části jsou analyzovány nejčastější nedostatky v hospodaření škol zjištěné kontrolní činností.The Bachelor thesis topic is the checking processes in the Czech school systém focusing on secondary school management. The theoretical part of the thesis states the basic terms used in the management area at secondary schools and the checking activities concerning financial supervision. The practical part is divided into two parts. The first one is focused on research based on questionnaires with the aim to verify the implementation and impact of audits in public administration. In the second part the most frequent deficiencies which were revealed in the management of the school during inspections, are analyzed.