Diplomová práca sa zameriava na identifikovanie kľúčových faktorov zmeny organizačnej štruktúry v inštitúcii verejnej správy. Jej teoretická časť popisuje organizáciu, jej poslanie, víziu, ciele, typy organizačných štruktúr a organizačnej kultúry, ako aj proces riadenia zmeny. Z hľadiska rozpracúvanej problematiky bolo potrebné venovať sa aj kvalite a systému jej merania v inštitúcii verejnej správy. Výskumná časť formou analýzy dokumentov, rozhovor s vedúcimi zamestnancami a prostredníctvom dotazníka pre zamestnancov popisuje dve zmeny organizačnej štruktúry vo vybranej inštitúcii a identifikuje dôležité faktory, z ktorých za najvýznamnejší považujem zapojenie zamestnancov organizácie do procesov, súvisiacich so zmenou štruktúry. Práca tiež vyhodnocuje spokojnosť zamestnancov s procesom zmeny.The thesis focuses on identifying of key factors in the organizational structure in a public institution. The theoretical part of the thesis describes the organization, its mission, vision, and goals, as well as types of organizational structures and organizational culture and change management process. In terms of elaboration of the topic it was essential to address the quality and the framework for its assessment. The research part of the thesis through the analysis of documents, interviews with management members and a questionnaire for employees describes two changes in the organizational structure in the chosen institution and identifies important factors, of which I consider the most significant the involvement of employees in the organization of processes associated with changing the structure. The thesis also evaluates how the employees were satisfied with the processes associated to the organisational change.